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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002532`

染色体: Chr08 坐标: 24547408-24548435 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002532`
名称	SmilChr08G002532
描述	uncharacterized SmilChr08G002532
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24547408 - 24548435 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998227`
GeneID	`130998227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998227`
原始查询	`SmilChr08G002532`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os04g0191000; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os04g0191000` - identity=31.8; qcov=0.457; evalue=2.06e-11; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08284 (RVP_2); PF13650 (Asp_protease_2); PF13975 (gag-asp_proteas); PF30863 (PRO_PEG10-RTL1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779640.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779640.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779640.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057779640.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779640.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24547424`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:24547441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A7,B127,C25,C49
`Chr8:24547447`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:24547485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B92,C68,C70
`Chr8:24547514`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:24547517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:24547519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:24547533`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr8:24547554`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B10,C29,C43,D4
`Chr8:24547554`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B10,C29,C43,D4
`Chr8:24547573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,C29,C43,D4
`Chr8:24547590`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779640.1

234 aa

117

234

gag-asp_proteas

RVP_2

Asp_protease_2

PRO_PEG10-RTL1

PF13975 gag-asp_proteas 2-86 aa PF08284 RVP_2 2-103 aa PF13650 Asp_protease_2 3-83 aa PF30863 PRO_PEG10-RTL1 5-103 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779640.1`	Pfam	`PF13975`	gag-asp_proteas	Domain	2	86	7.2e-10	40.0	gag-polyprotein putative aspartyl protease
`XP_057779640.1`	Pfam	`PF08284`	RVP_2	Domain	2	103	9.3e-25	87.7	Retroviral aspartyl protease
`XP_057779640.1`	Pfam	`PF13650`	Asp_protease_2	Domain	3	83	9.6e-09	36.6	Aspartyl protease
`XP_057779640.1`	Pfam	`PF30863`	PRO_PEG10-RTL1	Domain	5	103	3.9e-13	50.5	PEG10/RTL1 protease domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923657.1
ATGCCGATTATAGCTTTGTTCGATACTGGAGCGTCCCACTCTTTTATTTCACATGCTGCTTGTAAGAGATTAGAACTGACTCCACAATTGGCTGAGACAACTTTAGAGGTTAGCACCCCTGGTGGTGGAAGATTGGCTGCTAAGGACATTATCTCGAACTTAGAGCTGAACATAGGCGCTGAAACGTTTAAGGCAGATTTGTACGTCATCTCTATGATAGAATTCGACATCATCCTAGGGATGGACTGGCTTACTCAAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998227
ATGCCGATTATAGCTTTGTTCGATACTGGAGCGTCCCACTCTTTTATTTCACATGCTGCTTGTAAGAGATTAGAACTGACTCCACAATTGGCTGAGACAACTTTAGAGGTTAGCACCCCTGGTGGTGGAAGATTGGCTGCTAAGGACATTATCTCGAACTTAGAGCTGAACATAGGCGCTGAAACGTTTAAGGCAGATTTGTACGTCATCTCTATGATAGAATTCGACATCATCCTAGGGATGGACTGGCTTACTCAAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779640.1
MPIIALFDTGASHSFISHAACKRLELTPQLAETTLEVSTPGGGRLAAKDIISNLELNIGAETFKADLYVISMIEFDIILGMDWLTQVGATILCSERKISFQSAGKEKASFHGIRMGGRVPVISAMKATKIMRKGECQAFLVNLTGEREADKTIEEVPVVRDFKDVFPEELPNPKSQSQFQIPSPATSGAPRPPAVLLGRRQWEARSQSHRDPRPVAPPPSSDDSGAQSLRLRRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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