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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002537`

染色体: Chr08 坐标: 24620363-24625617 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002537`
名称	SmilChr08G002537
描述	NPL4-like protein 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24620363 - 24625617 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997177`
GeneID	`130997177`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997177`
原始查询	`SmilChr08G002537`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NPL4-like protein 2
产物	NPL4-like protein 2
Arabidopsis	`AT2G47970` (AT2G47970) Nuclear pore localization protein NPL4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819409] identity=72.2; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0377700` - identity=58; qcov=1.02; evalue=1.26e-168; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006511 (ubiquitin-dependent protein catabolic process); GO:0031625 (ubiquitin protein ligase binding); GO:0043130 (ubiquitin binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05021 (NPL4); PF11543 (UN_NPL4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997177

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778414.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057778414.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778414.1`
4	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778414.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778414.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24624544`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C13,C39,C83
`Chr8:24625265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B18,B56,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778414.1

411 aa

206

411

UN_NPL4

NPL4

PF11543 UN_NPL4 1-84 aa PF05021 NPL4 156-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778414.1`	Pfam	`PF11543`	UN_NPL4	Domain	1	84	4e-08	34.4	Nuclear pore localisation protein NPL4
`XP_057778414.1`	Pfam	`PF05021`	NPL4	Family	156	280	8.5e-17	62.2	NPL4 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922431.1
GAGTTTAGAATGAAATTGTGGAAGCTGAAGGGACTATATTGTGAATGGGGGGACAGAGTTGAAGTAGAAGTCGAAGTAGAAGAGAGAGAAGCCCCGAAACCCAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAAGAAGCGTGCTCCACTATAAAATCTTTCCTAAATTCTCGTCTCCTTCCCTACTCCAAACTCTTTTCTTCTTCTCCAATTATTCAATTCCTCACAATCACTGCTTAGTATCCTATATATATATATTTTGCGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997177
ATGATGATCAGAATCCGGAGCCGCGACGGTCTGGAGCGGGTCTCAATCGACAACCCGCGCGCCACCGTCGCCGCGCTCAAGTCGGCGATCGAATCCCAGCTCCGGGTGCCCGTGCAAGCCCAGATTCTCTCCACCAATCAAAATTTGCTTCTTGCCAAAACCCAAACCGATCTGACCCGGTTCACGGACATGATCGACCCAAACACTGGTCTTGGCGCGCTTAACATCGGCCACGGCTCAATTGTCTACCTCGCCTACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778414.1
MMIRIRSRDGLERVSIDNPRATVAALKSAIESQLRVPVQAQILSTNQNLLLAKTQTDLTRFTDMIDPNTGLGALNIGHGSIVYLAYEGERTVVGPTFHPSGSFGKKMTMDDLIAKQMRITHQENPHCELVSFDRDAANAFQHYVNESLAFAVKRGGFMYGTVSEEGKVEVDFIYEPPQQGTEENLILLRDPDEEKLVEAIALGLGMRKVGFIFTQTVSQDKKDYTMSNSEVLQAVELQAEGDLKEWVTAVVKLEVNEDGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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