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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002538`

染色体: Chr08 坐标: 24653161-24656667 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002538`
名称	SmilChr08G002538
描述	uncharacterized SmilChr08G002538
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24653161 - 24656667 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997178`
GeneID	`130997178`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997178`
原始查询	`SmilChr08G002538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824800]; symbol=AT3G56330; hit=AT3G56330; species=arabidopsis; confidence=high
产物	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824800]; symbol=AT3G56330; hit=AT3G56330; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G56330` (AT3G56330) N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824800] identity=61.1; qcov=0.962; evalue=3.01e-154; confidence=high
Rice	`Os05g0324200` - identity=46.3; qcov=0.519; evalue=1.65e-49; confidence=medium
GO	GO:0002940 (tRNA N2-guanine methylation); GO:0003723 (RNA binding); GO:0004809 (GO:0004809); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF02005 (TRM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997178

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778415.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057778418.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778415.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778415.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778415.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24653258`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B14,C51,C57,C75
`Chr8:24653269`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B6
`Chr8:24653269`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778415.1

439 aa

220

439

TRM

PF02005 TRM 51-405 aa

XP_057778416.1

406 aa

203

406

TRM

PF02005 TRM 51-383 aa

XP_057778417.1

398 aa

199

398

TRM

PF02005 TRM 51-387 aa

XP_057778418.1

366 aa

183

366

TRM

PF02005 TRM 51-351 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778415.1`	Pfam	`PF02005`	TRM	Family	51	405	5.7e-61	207.5	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
`XP_057778416.1`	Pfam	`PF02005`	TRM	Family	51	383	1.8e-52	179.5	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
`XP_057778417.1`	Pfam	`PF02005`	TRM	Family	51	387	3e-53	182.1	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase
`XP_057778418.1`	Pfam	`PF02005`	TRM	Family	51	351	4.1e-50	171.8	N2,N2-dimethylguanosine tRNA methyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922432.1
ACTTGTGAAAAGAATTGTATAAAACGATGGCCAAAAGCCCAATTTCTCTCAATTATCCCGCCATGTTATCTCTTCCGCCTAAAGCCCCACTCAGTTTCAAATCCCTAAACCCCACCAAAATCCAATGCTGCAAATCCCAAACCCAAACCGAGAGGGGCCACTCATTCGACACCGGTGACACCTTCTTCCGCCACGAGAGCGCCACTGGCCGCGACCTCGGCGTGCTTGCCGCTGCCGTTTACAAGAAAAACTACAATGCC...

XM_057922433.1
ACTTGTGAAAAGAATTGTATAAAACGATGGCCAAAAGCCCAATTTCTCTCAATTATCCCGCCATGTTATCTCTTCCGCCTAAAGCCCCACTCAGTTTCAAATCCCTAAACCCCACCAAAATCCAATGCTGCAAATCCCAAACCCAAACCGAGAGGGGCCACTCATTCGACACCGGTGACACCTTCTTCCGCCACGAGAGCGCCACTGGCCGCGACCTCGGCGTGCTTGCCGCTGCCGTTTACAAGAAAAACTACAATGCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130997178
ATGGCCAAAAGCCCAATTTCTCTCAATTATCCCGCCATGTTATCTCTTCCGCCTAAAGCCCCACTCAGTTTCAAATCCCTAAACCCCACCAAAATCCAATGCTGCAAATCCCAAACCCAAACCGAGAGGGGCCACTCATTCGACACCGGTGACACCTTCTTCCGCCACGAGAGCGCCACTGGCCGCGACCTCGGCGTGCTTGCCGCTGCCGTTTACAAGAAAAACTACAATGCCCTCCGGGTGCTCGACGCAATGTGCGG...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057778415.1
MAKSPISLNYPAMLSLPPKAPLSFKSLNPTKIQCCKSQTQTERGHSFDTGDTFFRHESATGRDLGVLAAAVYKKNYNALRVLDAMCGCGIRSLRYLAEAGADFVLANDANPDCGELISVNLERAGVEKERWEVKHLDANRLLTERYLERDYFDLIDVDSFGSDSTFLRSAMCSAKLDGLLYLTCTDGYSSGGHRPQHTLAAYGAYVKPMPYSNEIGLRMLIGGALREASVLGYHVVPLFSCYSYHGPVFRAMLQLRRGKF...

XP_057778416.1
MAKSPISLNYPAMLSLPPKAPLSFKSLNPTKIQCCKSQTQTERGHSFDTGDTFFRHESATGRDLGVLAAAVYKKNYNALRVLDAMCGCGIRSLRYLAEAGADFVLANDANPDCGELISVNLERAGVEKERWEVKHLDANRLLTERYLERDYFDLIDVDSFGSDSTFLRSAMCSAKLDGLLYLTCTDGYSSGGHRPQHTLAAYGAYVKPMPYSNEIGLRMLIGGALREASVLGYHVVPLFSCYSYHGPVFRAMLQLRRGKF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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