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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002539`

染色体: Chr08 坐标: 24666571-24669921 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002539`
名称	SmilChr08G002539
描述	superoxide dismutase [Mn], mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24666571 - 24669921 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997179`
GeneID	`130997179`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997179`
原始查询	`SmilChr08G002539`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	superoxide dismutase [Mn], mitochondrial-like
产物	superoxide dismutase [Mn]%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT3G10920` (MSD1) manganese superoxide dismutase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820263] identity=76.5; qcov=1.01; evalue=5.9e-133; confidence=high
Rice	`Os05g0323900` (SODA1) - identity=74.5; qcov=1.02; evalue=4.7e-125; confidence=high
GO	GO:0004784 (superoxide dismutase activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006801 (superoxide metabolic process); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	smil04146 (Peroxisome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00081 (Sod_Fe_N); PF02777 (Sod_Fe_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997179

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778419.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057778419.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778419.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778419.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778419.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24667532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr8:24667991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,C13,C39,C83
`Chr8:24668372`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr8:24669525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:24669715`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778419.1

227 aa

114

227

Sod_Fe_N

Sod_Fe_C

PF00081 Sod_Fe_N 25-106 aa PF02777 Sod_Fe_C 118-218 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778419.1`	Pfam	`PF00081`	Sod_Fe_N	Domain	25	106	1.6e-33	115.7	Iron/manganese superoxide dismutases, alpha-hairpin domain
`XP_057778419.1`	Pfam	`PF02777`	Sod_Fe_C	Domain	118	218	1.7e-36	125.1	Iron/manganese superoxide dismutases, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922436.1
CAAAATCATCTAGAACTGATTTTGTAAACGATTTCGTCCGGGAATTTATCAAACCGAATGTACTCGGTTAGCCTTAGTGAAGAGTGGAGGATTGGAGTTTAGGTTGACATCAAATTATCATCTCTCTCTCTCTACATTTTTCCAGAAGAGCGAGTGAGCTACTCCAATGGCGCTCCGAACCCTAATCACCAGAAATCCTCTGAGGGCGGCTGCTCCTCTCGCCTCCCGCGGCCTCCAGACTTTCTCGCTGCCCGATCTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997179
ATGGCGCTCCGAACCCTAATCACCAGAAATCCTCTGAGGGCGGCTGCTCCTCTCGCCTCCCGCGGCCTCCAGACTTTCTCGCTGCCCGATCTGCCCTACGATTACGGCGAGCTCGAGCCCGCTATCAGCGCCGAGATCATGCAGCTCCACCACCAGAAACACCACCAAGCTTACATCACCAATTACAACAAGGCCCTTGAGCAGCTCGACGCCGCCGCTGCTAAGGGCGACGCCTCCACCGTCGTCAAGCTTCAGAGCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778419.1
MALRTLITRNPLRAAAPLASRGLQTFSLPDLPYDYGELEPAISAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKALEQLDAAAAKGDASTVVKLQSAIKFNGGGHVNHSIFWKNLAPVRVGGGEPPHGSFGWAIDSNFGSFEALIQKMNAEGAALQGSGWVWLGLDKEFKRLVVETTGNQDPLVTKGASLVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYASDVFDKENAN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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