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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002543`

染色体: Chr08 坐标: 24715724-24719567 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002543`
名称	SmilChr08G002543
描述	transcription factor RF2b-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24715724 - 24719567 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997183`
GeneID	`130997183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997183`
原始查询	`SmilChr08G002543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor RF2b-like
产物	transcription factor RF2b-like
Arabidopsis	`AT2G40620` (AT2G40620) Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818657] identity=55.7; qcov=1.1; evalue=2.18e-116; confidence=high
Rice	`Os03g0336200` (RF2b) - identity=61; qcov=0.994; evalue=3.67e-112; confidence=high
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF00170 (bZIP_1); PF07716 (bZIP_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778423.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778423.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778423.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778423.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778423.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24717064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B25,C8,D11
`Chr8:24717388`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:24718975`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:24718984`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B10,B103,B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778423.1

343 aa

172

343

bZIP_2

bZIP_1

PF07716 bZIP_2 138-187 aa PF00170 bZIP_1 140-188 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778423.1`	Pfam	`PF07716`	bZIP_2	Coiled-coil	138	187	2.9e-06	27.9	Basic region leucine zipper
`XP_057778423.1`	Pfam	`PF00170`	bZIP_1	Coiled-coil	140	188	2.8e-08	34.4	bZIP transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922440.1
TGGCATAGGGCAAAAGCAATCGAGGGTGCAGATCCCATGCACACAACCCCACACCATGAAATGATTGCACTCTAAAAAAAAAGAAGTCCACTCAACTCCCAAATTGATTATACTTATTTTCAATACACAGACTCCCCTTTTCTCGTCAACCAGAAACAGTTAAATCCACTCCCCATCATCCCAACTGCAAGAACAAGAACCCACACCCAAAAGGTGCCAACTTTTTCAACTACTCGAGCTCAGAGATGCAAGATCCCAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997183
ATGCAAGATCCCAACTCCAAGCAGCAGGTCAGCCAAATGCCGCCCTTCTCCGGCGCAATGCGGCCCTCCCAGCACCGCCGCGCCCACTCCGAGGTCAACTTCCGCCTCCCGGAGGACCTAGATCTGGGCTCCGACCCCTTCGACGCGCCGGCGGGGAGTTTCGAGGAGATGGGATCCGAGGACGATCTCTTCTCCACCTACATGGACATAGAGAAGCTCAGCGCCGGACCTGGATCTGGACCTACCGACAATGCCGCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778423.1
MQDPNSKQQVSQMPPFSGAMRPSQHRRAHSEVNFRLPEDLDLGSDPFDAPAGSFEEMGSEDDLFSTYMDIEKLSAGPGSGPTDNAAAADDDADKTAASRPRHRHSNSVDSSSFLFNDNSIEAKKAMPPDKLAELWTIDPKRAKRILANRQSAARSKERKARYISELERKVQTLQTEATTLSAQLTLFQRDTTGLSNENTELKLRLQAMEQQAQLRDALNEALRQEVERLRVATGEMSTTSDTFNLTMQHLPYNQTTFFSN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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