当前解析结果
SmilChr08G002546| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002546 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002546 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002546 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 24741658 - 24742893 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997187 |
|---|---|
| GeneID | 130997187 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997187 |
| 原始查询 | SmilChr08G002546 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824803]; symbol=AT3G56360; hit=AT3G56360; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824803]; symbol=AT3G56360; hit=AT3G56360; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT3G56360 (AT3G56360)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824803] identity=43.7; qcov=0.671; evalue=3.29e-38; confidence=medium |
| Rice | Os03g0736900- identity=34.2; qcov=0.689; evalue=5.65e-20; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25089 (DUF7804) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997187 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057778426.1 |
| 2 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.80000 | XP_057778426.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778426.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778426.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778426.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:24742388 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,D9 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778426.1PF25089
DUF7804 83-153 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778426.1 |
Pfam | PF25089 |
DUF7804 | Domain | 83 | 153 | 6e-24 | 84.8 | Domain of unknown function (DUF7804) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。