当前解析结果
SmilChr08G002552| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002552 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002552 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002552 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 24817449 - 24818803 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998230 |
|---|---|
| GeneID | 130998230 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998230 |
| 原始查询 | SmilChr08G002552 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998230 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779644.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.40000 | XP_057779644.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779644.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779644.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779644.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:24817464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B108 |
Chr8:24817464 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr8:24817465 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | A2,A22,A23,A9,B127,B134,B25,B43,B45,B51,B56,B62,B69,B91,B93,B98,C2,C23,C67,C72,C79,C8,C80,C84,D6,D8 |
Chr8:24817470 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr8:24817476 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B108,B25,C8 |
Chr8:24817498 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B125,C21,C36,C87 |
Chr8:24817500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B24,B45,C50 |
Chr8:24817523 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B121,B81,C35 |
Chr8:24817541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B108 |
Chr8:24817541 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B108 |
Chr8:24817547 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B41,B58,C43 |
Chr8:24817561 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C72 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。