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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002566`

染色体: Chr08 坐标: 24998597-25000654 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002566`
名称	SmilChr08G002566
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	24998597 - 25000654 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998232`
GeneID	`130998232`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998232`
原始查询	`SmilChr08G002566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=22.9; qcov=0.727; evalue=6.56e-19; confidence=weak
Rice	`Os11g0681300` - identity=23.3; qcov=0.791; evalue=3.58e-21; confidence=weak
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998232

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779646.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779646.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779646.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779646.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779646.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:24998662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,C26
`Chr8:24998711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:24998731`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D2
`Chr8:24998889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:24998909`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:24998923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:24999403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C63
`Chr8:24999957`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C61
`Chr8:25000042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:25000057`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B20
`Chr8:25000077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B20,C29
`Chr8:25000205`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B20,B44,B99,C42,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779646.1

450 aa

225

450

MULE

PF10551 MULE 81-156 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779646.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	81	156	2.2e-16	60.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923663.1
ATGGTTCCTACTGTATCTAGACACCTTATGCCCGTGAACAAGAACGTTACCCCTGCCCATGAGATGTGGATTACGTCTGCGATTAAAGCAAACATTGGGCCTATTAGATCTTTCCGTATGTACAGAGAGATTATGGGCGAGTATGAGGATATTGGTTGCGTCAACGATGAGAAGAGGCTTTGTCGGTTGATTTGGACCGACGAAGTCTCTGTTAAGAACTACAAATTATTTGGTGAAGCCGTGTCCTTCGACGCAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998232
ATGGTTCCTACTGTATCTAGACACCTTATGCCCGTGAACAAGAACGTTACCCCTGCCCATGAGATGTGGATTACGTCTGCGATTAAAGCAAACATTGGGCCTATTAGATCTTTCCGTATGTACAGAGAGATTATGGGCGAGTATGAGGATATTGGTTGCGTCAACGATGAGAAGAGGCTTTGTCGGTTGATTTGGACCGACGAAGTCTCTGTTAAGAACTACAAATTATTTGGTGAAGCCGTGTCCTTCGACGCAACATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779646.1
MVPTVSRHLMPVNKNVTPAHEMWITSAIKANIGPIRSFRMYREIMGEYEDIGCVNDEKRLCRLIWTDEVSVKNYKLFGEAVSFDATYNTNRYKMIFTPFTGRDNHGKCLSFGAAIISREDVDSYSWVLEKFVECVGNAPPLLITDQDSGLKKAVAADNRWFSDMFDDRSHWIPAYFRDVSMSGLFRTTLLSESKNSYFKRALEAQRHNYHKTTFADETGVLPMKTRLKIEKYAATIYINNIFKEVQDEIDASQTYCNMYQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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