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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002568`

染色体: Chr08 坐标: 25057145-25061493 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002568`
名称	SmilChr08G002568
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25057145 - 25061493 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997207`
GeneID	`130997207`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997207`
原始查询	`SmilChr08G002568`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
产物	probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase IRK
Arabidopsis	`AT3G56370` (AT3G56370) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824804] identity=64.7; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0335500` - identity=60; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2); PF13516 (LRR_6); PF13855 (LRR_8); PF23598 (LRR_14)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997207

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778441.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778441.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778441.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778441.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778441.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25058756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B7,B80
`Chr8:25059738`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr8:25059960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B139
`Chr8:25060018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778441.1

976 aa

488

976

LRRNT_2

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_14

LRR_1

LRR_8

LRR_1

LRR_14

LRR_1

LRR_6

LRR_1

LRR_8

LRR_1

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF08263 LRRNT_2 28-69 aa PF00560 LRR_1 99-120 aa PF13855 LRR_8 99-158 aa PF00560 LRR_1 123-142 aa PF00560 LRR_1 147-169 aa PF13855 LRR_8 147-206 aa PF00560 LRR_1 172-192 aa PF23598 LRR_14 193-370 aa PF00560 LRR_1 196-217 aa PF00560 LRR_1 244-265 aa PF13855 LRR_8 270-326 aa PF00560 LRR_1 291-313 aa PF00560 LRR_1 315-336 aa PF23598 LRR_14 390-542 aa PF00560 LRR_1 391-413 aa PF00560 LRR_1 415-437 aa PF00560 LRR_1 440-461 aa PF13516 LRR_6 485-500 aa PF00560 LRR_1 487-509 aa PF13855 LRR_8 487-546 aa PF00560 LRR_1 512-533 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 691-958 aa PF00069 Pkinase 692-902 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	28	69	3.7e-11	43.8	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	99	120	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	99	158	1.6e-38	131.0	Leucine rich repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	123	142	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	147	169	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	147	206	1.6e-38	131.0	Leucine rich repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	172	192	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	193	370	9.7e-31	107.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	196	217	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	244	265	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	270	326	1.6e-38	131.0	Leucine rich repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	291	313	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	315	336	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF23598`	LRR_14	Repeat	390	542	9.7e-31	107.5	Leucine-rich repeat region
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	391	413	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	415	437	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	440	461	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF13516`	LRR_6	Repeat	485	500	3.4e-10	39.9	Leucine Rich repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	487	509	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	487	546	1.6e-38	131.0	Leucine rich repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	512	533	1.6e-51	161.8	Leucine Rich Repeat
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	691	958	2.5e-44	152.3	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057778441.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	692	902	5.6e-40	138.1	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922458.1
TTCCCTTCCCACTCTACTTTATTTTTTCCCGTTGATAAATGCATGTCTCCCTCTCTCATCTGCTGCAATAAAGTGTAGAGAGAGAGAAAGAGAGAGAGAGAGATGGCTCTTCCGTTGGTCGACTGACCTCCATTGCCGGAAAACTCGCACTGCATCCCCATTTCCTGCATGTTTCTCCGGTAACACTCAGTCTGCAACTACTCCATTTTCCTCAGAGACGCTCAGGCGAAGTGTTTTCTCACATTCGAGCTCTATCCTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997207
ATGAGGAGTGTTGTTAGCCTTGTATTCCTTTCGTTTTTCATTTGCCTAACTCCGTTGTTAGTGAAGTCGTTGAGCCCGTCTTTGAATGACGATGTTCTGGGATTAATTGTGTTCAAAGCTGATATTCAAGATCCTGATGGGAAATTGAGTTCTTGGAGTGAAGATGCTGACAGCCCGTGTAACAATTGGGTTGGGATCAAATGCAACCCTAGATCCAATAGAGTTTCTGATCTTGTCCTTGATGGCTTTGGCCTCTCGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778441.1
MRSVVSLVFLSFFICLTPLLVKSLSPSLNDDVLGLIVFKADIQDPDGKLSSWSEDADSPCNNWVGIKCNPRSNRVSDLVLDGFGLSGKLGRGLLQLRFLRKLSLANNNFTGSLSLSFAQLSDLRVLDLSENGLSGEIPSDFFSQCGSLRSISLSKNRFSGSVPESLGSCSTLASLNLSGNQFSGALPVGMWSMTGLRSLDLSENMLEGEIPKGIEGLNNLRVISLRSNVFSGEVPDGIGDCMLLRSVDLSRNSFSGGLPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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