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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002589`

染色体: Chr08 坐标: 25220183-25225772 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002589`
名称	SmilChr08G002589
描述	protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25220183 - 25225772 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997227`
GeneID	`130997227`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997227`
原始查询	`SmilChr08G002589`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 4-like
产物	protein ENHANCED DISEASE RESISTANCE 4-like
Arabidopsis	`AT5G05190` (AT5G05190) - identity=52.6; qcov=0.081; evalue=3.68e-20; confidence=weak
Rice	`Os02g0464500` - identity=29; qcov=0.233; evalue=1.18e-11; confidence=weak
GO	GO:1900150 (regulation of defense response to fungus)
KEGG	-
Pfam	PF11331 (Zn_ribbon_12); PF22910 (EDR4-like_1st)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997227

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057778468.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057778468.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778468.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778468.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25220687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B138,B47,B55
`Chr8:25221132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B128,B17,B20,D1
`Chr8:25221416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,B88
`Chr8:25221467`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B16,B90,B92
`Chr8:25221708`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,C46
`Chr8:25221742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36
`Chr8:25221825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C6
`Chr8:25221857`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B107,C40,C46
`Chr8:25221910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25221919`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25221971`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:25221983`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778468.1

933 aa

466

933

EDR4-like_1st

Zn_ribbon_12

PF22910 EDR4-like_1st 8-41 aa PF11331 Zn_ribbon_12 735-779 aa

XP_057778469.1

933 aa

466

933

EDR4-like_1st

Zn_ribbon_12

PF22910 EDR4-like_1st 8-41 aa PF11331 Zn_ribbon_12 735-779 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778468.1`	Pfam	`PF22910`	EDR4-like_1st	Domain	8	41	2.9e-16	59.4	Enhanced disease resistance 4-like, N-terminal domain
`XP_057778468.1`	Pfam	`PF11331`	Zn_ribbon_12	Domain	735	779	4.8e-16	59.0	EDR4 zinc-ribbon domain
`XP_057778469.1`	Pfam	`PF22910`	EDR4-like_1st	Domain	8	41	2.9e-16	59.4	Enhanced disease resistance 4-like, N-terminal domain
`XP_057778469.1`	Pfam	`PF11331`	Zn_ribbon_12	Domain	735	779	4.8e-16	59.0	EDR4 zinc-ribbon domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922485.1
AGGTTGACTTGGTAAAAGTTGCAACCATAAACAAACACAACTCAAGTGTAGCAAATCAAATGTGTTCATGTAGCTTCACTCCAACTAACAACCGACTCCTTTTTTCCTCTGTGTTCACAAATCACAACCAAGATTAGTGCGTGTTGATTATGTGTGTAACGCTGTGTGCTTTCACAATCACATACTAATGTCTCGAGAATTCGACTTTTGAGTCTGGCAAGCTTCCCACACACGGCACCAACAAGACTCAACCATCATTG...

XM_057922486.1
AGTTTGAATGTTTCTGTTTCGGTGTTGTATCGAAGTTTTGAATTTGTTTTTTTGGAACTGCGATCGTTCGACTGGAGTGAAGTACCAGTGAAACATGACTACTCAAGGGAATGTACAAATTCGATTTGTTAAATGCCCGAGGTGCCGAAAGATTCTACCAGAGTTGCCAGAGCTTCGAATGTACAAGTGCGGAGGGTGTGGCATTACTCTACAAGCTAAACAACGAAAACCAGAGACTAACCACACTGAATTACCCTCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997227
ATGACTACTCAAGGGAATGTACAAATTCGATTTGTTAAATGCCCGAGGTGCCGAAAGATTCTACCAGAGTTGCCAGAGCTTCGAATGTACAAGTGCGGAGGGTGTGGCATTACTCTACAAGCTAAACAACGAAAACCAGAGACTAACCACACTGAATTACCCTCACAAGAAACAGATTCTGCAGACGAAGACCGGAAGGATAATGTTTTAGGAGAGACGGAAGACAGAAGCTCAAACGTTGAATCTTCGCCAGATGAAGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778468.1
MTTQGNVQIRFVKCPRCRKILPELPELRMYKCGGCGITLQAKQRKPETNHTELPSQETDSADEDRKDNVLGETEDRSSNVESSPDEGEIRRQDDCDGSVVLSHNRGASDGLSGSPDITSPRSEGSPSEVEQSCKNNALGRNPETYRGKSEDECDDSVELPHYRGASDGISGCETSPSEVQESLEDNPLVGSPQKYRSKSDDHEEWIAGSNSLDELPSSGEISLEGEVCTPEASEYVEQHNPSHMHLEHMEDGESQRVWPK...

XP_057778469.1
MTTQGNVQIRFVKCPRCRKILPELPELRMYKCGGCGITLQAKQRKPETNHTELPSQETDSADEDRKDNVLGETEDRSSNVESSPDEGEIRRQDDCDGSVVLSHNRGASDGLSGSPDITSPRSEGSPSEVEQSCKNNALGRNPETYRGKSEDECDDSVELPHYRGASDGISGCETSPSEVQESLEDNPLVGSPQKYRSKSDDHEEWIAGSNSLDELPSSGEISLEGEVCTPEASEYVEQHNPSHMHLEHMEDGESQRVWPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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