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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002603`

染色体: Chr08 坐标: 25402305-25403450 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002603`
名称	SmilChr08G002603
描述	uncharacterized SmilChr08G002603
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25402305 - 25403450 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997241`
GeneID	`130997241`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997241`
原始查询	`SmilChr08G002603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0125300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`ATMG00820` - identity=38.2; qcov=0.618; evalue=1.57e-06; confidence=low
Rice	`Os08g0125300` - identity=43.2; qcov=0.4; evalue=1.09e-06; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997241

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778485.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778485.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778485.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778485.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778485.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25402695`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C35,C46
`Chr8:25402710`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25402721`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C35,C46
`Chr8:25402737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:25402764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:25402824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:25402857`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	145	A1,A10,A13,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A22,A3,A4,A6,A7,A9,B1,B10,B102,B103,B105,B106,B107,B111,B113,B114,B115,B117,B12,B120,B121,B122,B123,B125,B126,B130,B134,B136,B138,B139,B14,B18,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B3,B30,B31,B33,B34,B35,B36,B4,B40,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B60,B64,B65,B66,B67,B69,B70,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B82,B83,B84,B9,B90,B92,B94,B96,B98,C10,C11,C12,C15,C16,C2,C21,C22,C25,C27,C28,C32,C34,C36,C38,C4,C41,C42,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C51,C52,C54,C56,C59,C6,C61,C62,C63,C68,C69,C71,C72,C73,C76,C78,C79,C80,C81,C84,C85,C9,D1,D10,D2,D4,D5,D7,D8
`Chr8:25402978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B120,C41
`Chr8:25403001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr8:25403024`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:25403031`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B96
`Chr8:25403031`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922502.1
GGTTGATGATGTGTCTACTGCATGTTTTCTTATCAATCATATGTTTTCTATTATTCTTCGTGGCGAGTCTCCGTTTCATGTTCTTTTTCCATGTAAGAATGTGTTTCCTGTAGAGCCTAAAATATTTAGTAGTACTTGTTATGTTCGGATGTTAGGCCTCAAGTTACTAAATTGGATCAGAAGTCCTTAAAATGTATCTTTTTGGGGTACTCTAGAGTACAAAAGGGTTATCGTTATTTTTGTCCTAGTCTTAATAGGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997241
ATGACTTCTCCGGTTGTTCCTCCATCTGATTATGCTAGGCCTCCTATCGTACACACTTATTATCGCCATCGTCCACCTTCCGTACCTGCTATTGCTGAGTTGGTTCCCAATACATCTATATTGTGTCCCATTCAACCAATATCTTCATCGACAAATCCTCCTTCAAGTGATGATCATCTTATTGCTCTTCAAAAAGAAGGCTTAGGCTCTCCTGGTTGGCGTGCTGCCATGACTGAGAAACTCAATGCTTTGTTGGGTAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778485.1
MTSPVVPPSDYARPPIVHTYYRHRPPSVPAIAELVPNTSILCPIQPISSSTNPPSSDDHLIALQKEGLGSPGWRAAMTEKLNALLGNGTWVLVDLLAGKRASGCKWVFTS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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