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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002623`

染色体: Chr08 坐标: 25604758-25608437 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002623`
名称	SmilChr08G002623
描述	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25604758 - 25608437 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997262`
GeneID	`130997262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997262`
原始查询	`SmilChr08G002623`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1, chloroplastic
产物	light-harvesting complex-like protein 3 isotype 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G17600` (LIL3:1) Chlorophyll A-B binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827479] identity=62.7; qcov=0.683; evalue=2.94e-71; confidence=high
Rice	`Os02g0125700` (OsLIL3) - identity=61.6; qcov=0.674; evalue=9.56e-69; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30879 (LIL3_)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778510.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057778510.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057778510.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057778510.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778510.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25605202`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D4
`Chr8:25605217`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C46,D4
`Chr8:25605287`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A24,B10,B118,B119,B34,B37,B61,B95,C10,C12,C17,C38,C40,C48,C58,C74,C83,D9
`Chr8:25605323`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:25605337`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C73
`Chr8:25605374`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25608019`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A11,A14,A2,A3,B101,B113,B114,B118,B121,B122,B124,B133,B19,B24,B3,B37,B38,B4,B47,B50,B52,B55,B60,B71,B79,C17,C21,C30,C38,C41,C5,C52,C59,C61,C64,C75,C78,C79,C81,C84,D3,D6,D9
`Chr8:25608021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B6,B62,C9
`Chr8:25608024`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	40	A11,A14,A3,B101,B113,B114,B118,B121,B122,B124,B133,B19,B24,B37,B38,B4,B50,B52,B55,B60,B71,B79,C17,C21,C30,C38,C41,C5,C52,C59,C61,C64,C75,C78,C79,C81,C84,D3,D6,D9
`Chr8:25608027`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	36	A11,A14,B101,B113,B114,B118,B121,B122,B124,B133,B19,B24,B37,B38,B4,B50,B52,B55,B60,B71,B79,C17,C30,C38,C52,C59,C61,C64,C75,C78,C79,C81,C84,D3,D6,D9
`Chr8:25608043`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	C17,C61,C64
`Chr8:25608043`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	3	C17,C61,C64

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778510.1

224 aa

112

224

LIL3_

PF30879 LIL3_ 58-135 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778510.1`	Pfam	`PF30879`	LIL3_	Domain	58	135	7.5e-39	132.7	Light-harvesting-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922527.1
TTCCCTTTAGGTTTTCGTTGAAAAGATTTAAATAAGGCTCGGTCCTTAATTTTATTTTATTTTTTTATGTTTTCAAGGGTTTTATTTTTAAATTTTCTTTTTCTTTTTCTCCATTCAACAAATTCTTATCAATAACCCCAACGCACCAAGCATTTAATTGATGGCTAACATTTAATTTTCACATCGTACTATTAACACAATAATAAATTTGACAGTGGGAGTCCAACTCTGAATGGAGAATGAATTGGAAGTTTGACATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997262
ATGGCATCCATTGGCATAAGTGCTTCCACACAAAGAGCTTGCAGCTCTCAACATATCACTAAGAAGGTGTCTGCTGAGGCTAGACATCATGTTGTCACCCCCAACCCCAACGTTGAACCTCTAAAATTACCCCAAAAACAACAACACCATCAGCCTCCATTGGACCAACAAAGATTTAGTGACGCCAGATGGAAGAATGGCACGTGGGATCTCAACATGTTTGTAAAACAGGGAAGAATGGATTGGGACTCTCTTATTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778510.1
MASIGISASTQRACSSQHITKKVSAEARHHVVTPNPNVEPLKLPQKQQHHQPPLDQQRFSDARWKNGTWDLNMFVKQGRMDWDSLIVAEAKRRKFLEVYPEASRNEEAVAFRSSIIPWWVWIVHSHLPEAELLNGRAAMVGFFMAYIVDAMTGLNVVGQTGNFICKVALLFTVVGLLLFRRKEDIENIKKLADEATYYDKQWQASWENPDTTTVVKDNSIKNNR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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