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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002628`

染色体: Chr08 坐标: 25648986-25656869 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002628`
名称	SmilChr08G002628
描述	protein ORANGE, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25648986 - 25656869 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997267`
GeneID	`130997267`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997267`
原始查询	`SmilChr08G002628`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein ORANGE, chloroplastic
产物	protein ORANGE%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G61670` (AT5G61670) orange protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836289] identity=78.5; qcov=1; evalue=4.34e-171; confidence=high
Rice	`Os02g0651300` - identity=83; qcov=0.851; evalue=4.18e-159; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30754 (Orange_mid); PF30755 (Orange_N); PF30758 (Orange_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997267

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778514.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057778514.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778514.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778514.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778514.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25650556`	`GCC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	B139,B26,B35,B44,B60,B71,B73,B85,C21,C34,C72,C75,C76,C80,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778514.1

326 aa

163

326

Orange_N

Orange_mid

Orange_C

PF30755 Orange_N 61-111 aa PF30754 Orange_mid 140-225 aa PF30758 Orange_C 226-280 aa

XP_057778515.1

303 aa

152

303

Orange_N

Orange_mid

Orange_C

PF30755 Orange_N 61-111 aa PF30754 Orange_mid 140-225 aa PF30758 Orange_C 226-302 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778514.1`	Pfam	`PF30755`	Orange_N	Domain	61	111	7.5e-31	106.4	ORANGE protein N-terminal domain
`XP_057778514.1`	Pfam	`PF30754`	Orange_mid	Domain	140	225	5.6e-47	158.6	ORANGE protein middle domain
`XP_057778514.1`	Pfam	`PF30758`	Orange_C	Domain	226	280	1.4e-16	61.3	ORANGE protein C-terminal domain
`XP_057778515.1`	Pfam	`PF30755`	Orange_N	Domain	61	111	6.7e-31	106.6	ORANGE protein N-terminal domain
`XP_057778515.1`	Pfam	`PF30754`	Orange_mid	Domain	140	225	5e-47	158.8	ORANGE protein middle domain
`XP_057778515.1`	Pfam	`PF30758`	Orange_C	Domain	226	302	1.8e-36	125.1	ORANGE protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922532.1
CAAAGCCACATCATATTCAGCATTTTTCAAAGATGTTTTTGTCTCCTCAAGTTAATCATAATTTTTAATTTTAAAATATTGGTCATTATGTGAGTAATACACGTGGCACCTATGTTTTCTGGTGGAATTTTTTTTTGAGTTTAAGCTCACCACTAAAGACAGCTCCTCCAATGCACGTTGACGTTGTCTCCATTTACACTAACTCTCCAAAACCCTTGATCTCATAAAATTACCCCTTTAATTTCTTCATCAAATTGATT...

XM_057922531.1
ACCTATGTTTTCTGGTGGAATTTTTTTTTGAGTTTAAGCTCACCACTAAAGACAGCTCCTCCAATGCACGTTGACGTTGTCTCCATTTACACTAACTCTCCAAAACCCTTGATCTCATAAAATTACCCCTTTAATTTCTTCATCAAATTGATTTACAAGAAAAAGATGCTATGTTCTGGTCGAATTCTAGCTATTTCTCACTCCACCACGCGGTTTGATTCATCGGGATCGAGGCGGTATCCACACAAACAGCTCCAACC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997267
ATGCTATGTTCTGGTCGAATTCTAGCTATTTCTCACTCCACCACGCGGTTTGATTCATCGGGATCGAGGCGGTATCCACACAAACAGCTCCAACCCAGGATCAAATGGCGCTCCAAGGCGTCGGACGCCGGCTCCTCCTCTTTTTCTTCCTCGGATGATAAGACTTCCGTTCCGTTTTGTATAATAGAAGGGCCCGAGACTGTTCAGGATTTCGCGAAAATGGAATTACAGGAGATTCAGGATAATATCCGAGGTCGAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778514.1
MLCSGRILAISHSTTRFDSSGSRRYPHKQLQPRIKWRSKASDAGSSSFSSSDDKTSVPFCIIEGPETVQDFAKMELQEIQDNIRGRRNKIFLLMEEVRRLRIQQRIKNTELGIVKEEQENELPNFPSFIPFLPPLNSTNLKQYYASCFSLIAGIMLFGGLLAPTLELKLGIGGTSYSDFISSMHLPMQLSQVDPIVASFSGGAVGVISALMVVEINNVKQQEHKRCKYCLGTGYLACARCSSTGSLVLIEPVSKFNGGDQ...

XP_057778515.1
MLCSGRILAISHSTTRFDSSGSRRYPHKQLQPRIKWRSKASDAGSSSFSSSDDKTSVPFCIIEGPETVQDFAKMELQEIQDNIRGRRNKIFLLMEEVRRLRIQQRIKNTELGIVKEEQENELPNFPSFIPFLPPLNSTNLKQYYASCFSLIAGIMLFGGLLAPTLELKLGIGGTSYSDFISSMHLPMQLSQVDPIVASFSGGAVGVISALMVVEINNVKQQEHKRCKYCLGTGYLACARCSSTGSLVLIEPVSKFNGGDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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