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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002631`

染色体: Chr08 坐标: 25703626-25707868 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002631`
名称	SmilChr08G002631
描述	cyclin-U4-1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25703626 - 25707868 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997270`
GeneID	`130997270`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997270`
原始查询	`SmilChr08G002631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-U4-1-like
产物	cyclin-U4-1-like
Arabidopsis	`AT2G44740` (CYCP4;1) cyclin p4;1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819082] identity=64.9; qcov=0.864; evalue=3.25e-85; confidence=high
Rice	`Os10g0563900` (CycU4) - identity=56; qcov=0.824; evalue=5e-64; confidence=high
GO	GO:0000079 (regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity); GO:0019901 (protein kinase binding)
KEGG	-
Pfam	PF00134 (Cyclin_N); PF08613 (Cyclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997270

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778519.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778519.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778519.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778519.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25703683`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A10,A19,A5,A7,B112,B118,B120,B129,B132,B136,B15,B17,B19,B24,B29,B34,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B56,B60,B63,B75,B8,B82,B88,B9,B94,B96,C15,C22,C27,C29,C30,C31,C41,C51,C54,C57,C59,C71,C85,C86,D7,D9
`Chr8:25703935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:25704056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B90,B92
`Chr8:25707554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B48,B68
`Chr8:25707554`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B48,B68
`Chr8:25707562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B100,B49,B57,B85
`Chr8:25707573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B127,B136,C27,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778519.1

221 aa

110

221

Cyclin

Cyclin_N

PF08613 Cyclin 68-178 aa PF00134 Cyclin_N 88-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778519.1`	Pfam	`PF08613`	Cyclin	Family	68	178	6.9e-39	134.3	Cyclin
`XP_057778519.1`	Pfam	`PF00134`	Cyclin_N	Domain	88	179	1.4e-09	38.4	Cyclin, N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922536.1
ATTTCACGTTAAACACAATGCCGTTCTACATTTCACATTCATTACTATATATATACAAACACACACACACACACACTTTTTCTGATCAGTTTATATATAAAATGAGTAGTGAATCAATGGCGGAGCTAGAGATCCCCGACGTTATGCTGAAGATGATAAGATTTCTGTCGTCCCTCCTGCAAAGAGTGGCAGAATCCAACGATGAATTCCGGTGCTTGGACGCGGAGAAGACGTCGATCTTCGACGGCCTAAGTCGGCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997270
ATGCCGTTCTACATTTCACATTCATTACTATATATATACAAACACACACACACACACACTTTTTCTGATCAGTTTATATATAAAATGAGTAGTGAATCAATGGCGGAGCTAGAGATCCCCGACGTTATGCTGAAGATGATAAGATTTCTGTCGTCCCTCCTGCAAAGAGTGGCAGAATCCAACGATGAATTCCGGTGCTTGGACGCGGAGAAGACGTCGATCTTCGACGGCCTAAGTCGGCCGGCGATCTCGATCGAGTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778519.1
MPFYISHSLLYIYKHTHTHTFSDQFIYKMSSESMAELEIPDVMLKMIRFLSSLLQRVAESNDEFRCLDAEKTSIFDGLSRPAISIECYMERIFKYANCSPSCIVVAYIYLDRFAQKQPMLPLNSFNVHRLLIASVLLSAKFMDDIFYNNAYYAKVGGISTSEMNLLEVDFLFGLGFQLNVSTSTYHHYCSYLQKEMLLHCPPLTVTPNLLRSRNIHLYVDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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