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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002632`

染色体: Chr08 坐标: 25717660-25723156 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002632`
名称	SmilChr08G002632
描述	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25717660 - 25723156 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997271`
GeneID	`130997271`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997271`
原始查询	`SmilChr08G002632`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-9 specific SUVH5-like
产物	histone-lysine N-methyltransferase%2C H3 lysine-9 specific SUVH5-like
Arabidopsis	`AT2G35160` (SUVH5) SU(VAR)3-9 homolog 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818083] identity=42.4; qcov=0.594; evalue=5.98e-132; confidence=medium
Rice	`Os09g0362900` (OsSET35) - identity=42.1; qcov=0.581; evalue=1.66e-117; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0034968 (GO:0034968); GO:0042054 (histone methyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00856 (SET); PF02182 (SAD_SRA); PF05033 (Pre-SET)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997271

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778520.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778520.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778520.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778520.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25719091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B88,C41,C87
`Chr8:25719223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:25719580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C16,C53
`Chr8:25719581`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25719655`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B35,C61,C62
`Chr8:25719804`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:25719821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B13,B139,B140,B46
`Chr8:25720041`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B100,B49,B85
`Chr8:25720203`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B15,B41,C15,C22
`Chr8:25720510`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C13,C39,C83
`Chr8:25720622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C13,C39,C83
`Chr8:25720683`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778520.1

925 aa

462

925

SAD_SRA

Pre-SET

SET

PF02182 SAD_SRA 440-597 aa PF05033 Pre-SET 670-767 aa PF00856 SET 786-895 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778520.1`	Pfam	`PF02182`	SAD_SRA	Domain	440	597	3.2e-38	131.5	SAD/SRA domain
`XP_057778520.1`	Pfam	`PF05033`	Pre-SET	Family	670	767	1.6e-20	74.3	Pre-SET motif
`XP_057778520.1`	Pfam	`PF00856`	SET	Family	786	895	6.1e-23	82.0	SET domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922537.1
AGAAGAAGAACCGGCCCTTTCCTTCTTCTCAGCGCGGCAGCTTTTCGCTCCTTTGCTACTTGAATTTATAATTCGGTTTAATTTGAATACTATATAGTTCCTCTCACTCATTCCATATTTTTTTATTCATTTAGTTTTCCGATGAAATAAAATACTAATGCTGTCTTAAACTAAGAAGTAGGAATTCTCCTCCCTCTGAAAAAGAGAGGAATTTTAATCGATATAAAAACCACCAAGTTCGTGGAACTACCCAGTAACCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997271
ATGGTGAACTCATTAAGTTGGTCGAAAGTTTTGTGGAATATCTTGCTGCTTAATTACATCCAAATGATGACGTCGAAAAAATGTTTTGTAACTTCTGGCATGAATAGTGACAGTCATCCTTCTAATTTCAAGCCATCAGAGTCGAATGCTTTCTCGAGTTTCAGATCAAAATATGGTGCTGCCTCTCCTCATGCAGCTGTCTCTAATGCAACCAACCCGAAGCCAAATGCTGCTGCTGGGTTTCGAAGAGAAGATGAAAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778520.1
MVNSLSWSKVLWNILLLNYIQMMTSKKCFVTSGMNSDSHPSNFKPSESNAFSSFRSKYGAASPHAAVSNATNPKPNAAAGFRREDERSCNGKIPRSPDTAKYDMAIPAVPLRSVPIDAMKRKPKKPASSHGNDHDEGQKNAKTCSNTVNQEDDLWKQEVDKLEVVIAEAKEFIHLLDAKYSTPITFPAVEDLRKDPVVESKDQHSSLNSDAFPLHTSIDQRLSRKRLKVGSGVSVVVQAENATGTETMPEDDDGDEVSLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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