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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002639`

染色体: Chr08 坐标: 25826721-25827110 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002639`
名称	SmilChr08G002639
描述	uncharacterized SmilChr08G002639
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25826721 - 25827110 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998242`
GeneID	`130998242`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998242`
原始查询	`SmilChr08G002639`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=42.4; qcov=0.713; evalue=1.62e-18; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=49.6; qcov=0.984; evalue=1.03e-37; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998242

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779656.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779656.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057779656.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779656.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779656.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25826771`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B15,B41,C15,C22
`Chr8:25826849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	D11
`Chr8:25826849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25826852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B5,C5,C56,C9
`Chr8:25826904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:25826925`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	91	A15,A18,A2,A4,A6,A9,B10,B100,B101,B103,B105,B106,B108,B109,B113,B117,B119,B121,B122,B124,B127,B128,B130,B134,B136,B15,B16,B17,B2,B20,B29,B33,B36,B38,B39,B41,B45,B49,B56,B6,B62,B66,B67,B7,B70,B72,B74,B75,B78,B79,B8,B81,B87,B88,B94,B96,B97,B98,C12,C15,C2,C22,C24,C25,C26,C27,C32,C33,C34,C4,C43,C46,C5,C50,C51,C55,C59,C63,C65,C67,C68,C7,C72,C75,C79,C81,C84,C9,D1,D2,D4
`Chr8:25826931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,D6
`Chr8:25826945`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:25827002`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:25827027`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A11,A13,A24,B102,B105,B108,B11,B114,B126,B31,B5,B61,B76,B93,C19,C2,C3,C33,C37,C49,C58,C77
`Chr8:25827036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B15,B41,C15,C22
`Chr8:25827049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B67,C33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779656.1

129 aa

129

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 4-129 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779656.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	4	129	1.4e-36	126.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923673.1
ATGGCACGCCTTTTCAAAGTCACAGGCTCGAACAACGACATCAATGTGTTCAACCAATCAACGTTGTTCCACAACGTTCTTTGGGAAAATGCTTCGGTGGTGCACTTCGAGGCCAATAATGCCCATTATACAGCAGGTTACTACTTAACAAATGGAATCTACTCAGAGTGGCCAGTCTTCGTCAAGAGCCCCCCATTTCCTAGTGACGAAAATAATAAGAGGTTTAAAGTGATGCAAGAAGTTGCATGTAGGGACTTAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998242
ATGGCACGCCTTTTCAAAGTCACAGGCTCGAACAACGACATCAATGTGTTCAACCAATCAACGTTGTTCCACAACGTTCTTTGGGAAAATGCTTCGGTGGTGCACTTCGAGGCCAATAATGCCCATTATACAGCAGGTTACTACTTAACAAATGGAATCTACTCAGAGTGGCCAGTCTTCGTCAAGAGCCCCCCATTTCCTAGTGACGAAAATAATAAGAGGTTTAAAGTGATGCAAGAAGTTGCATGTAGGGACTTAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779656.1
MARLFKVTGSNNDINVFNQSTLFHNVLWENASVVHFEANNAHYTAGYYLTNGIYSEWPVFVKSPPFPSDENNKRFKVMQEVACRDLERDSGVLQARWTIIRGQARLWKKEQMGDLMFVCILYKLIIEDE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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