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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002653`

染色体: Chr08 坐标: 26018446-26021449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002653`
名称	SmilChr08G002653
描述	protein DYAD-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26018446 - 26021449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997291`
GeneID	`130997291`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997291`
原始查询	`SmilChr08G002653`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DYAD-like
产物	protein DYAD-like
Arabidopsis	`AT5G51330` (SWI1) SWITCH1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835207] identity=31.4; qcov=0.944; evalue=2.53e-76; confidence=low
Rice	`Os03g0650400` (OsAM1) - identity=31.9; qcov=0.893; evalue=3.05e-67; confidence=low
GO	GO:0007131 (reciprocal meiotic recombination); GO:0051177 (meiotic sister chromatid cohesion); GO:0051321 (meiotic cell cycle)
KEGG	-
Pfam	PF25874 (WHD_plant_repro); PF31005 (DYAD_N); PF31006 (DYAD_CC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997291

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778542.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778542.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778542.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778542.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778542.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26018550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:26018629`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:26019254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B60
`Chr8:26019266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:26019841`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B60
`Chr8:26020284`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26020919`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B35,B7,B99
`Chr8:26020919`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B35,B7,B99
`Chr8:26020925`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,B88
`Chr8:26020925`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,B88
`Chr8:26020931`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A24,C58
`Chr8:26020931`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A24,C58

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778542.1

719 aa

360

719

DYAD_N

WHD_plant_repro

DYAD_CC

PF31005 DYAD_N 1-54 aa PF25874 WHD_plant_repro 246-327 aa PF31006 DYAD_CC 408-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778542.1`	Pfam	`PF31005`	DYAD_N	Domain	1	54	1e-12	49.0	DYAD/AMEIOTIC1 N-terminal domain
`XP_057778542.1`	Pfam	`PF25874`	WHD_plant_repro	Domain	246	327	7.3e-25	87.4	Winged helix-turn-helix domain in plant reproductive proteins
`XP_057778542.1`	Pfam	`PF31006`	DYAD_CC	Coiled-coil	408	559	3.7e-40	138.6	DYAD/AMEIOTIC1 Coiled-coil

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922559.1
TTGCGAGAAGACGGAGGTGAATTTGGCTGTGAGGTTTCCGAGTATGGAGTCGCTGAGAGCATTCTTCAACTACAGCTCAAGAGAATCGCACCCAGCTTTGGATGAGAAGTTTGTGATGGGGTCGGCGCTAGCGGAGAGAGTTCTTGTTAGATCAGTCCCTGCCGAGATTTTCGCAGAGAAGAAGAGTGAGTTAGGTTTCTGGCTGATTAGTTCTGCGGAAGCTGCTGCTTCTAGTAAAGGCAAGGCAGGAGGTAGTTGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997291
ATGGAGTCGCTGAGAGCATTCTTCAACTACAGCTCAAGAGAATCGCACCCAGCTTTGGATGAGAAGTTTGTGATGGGGTCGGCGCTAGCGGAGAGAGTTCTTGTTAGATCAGTCCCTGCCGAGATTTTCGCAGAGAAGAAGAGTGAGTTAGGTTTCTGGCTGATTAGTTCTGCGGAAGCTGCTGCTTCTAGTAAAGGCAAGGCAGGAGGTAGTTGTCTCTCTGAGGCATTAAAGGGGAATGGATGGGGGATAAAAAGGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778542.1
MESLRAFFNYSSRESHPALDEKFVMGSALAERVLVRSVPAEIFAEKKSELGFWLISSAEAAASSKGKAGGSCLSEALKGNGWGIKRQVKYLGRHKESEGSDVYIAQNSSSSFVNGAEESHKRLVSACDDGEKDGDMENGEDQENAEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEEDEEEEEEEEDEKIKVKKNNENLKRKRYSFRNLSAKKTKKAKLEIRNQKQKQTQKKNQMIKKNKGRKRSRESLILRDPKDRWSAERYKLAEQNLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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