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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002655`

染色体: Chr08 坐标: 26028874-26032258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002655`
名称	SmilChr08G002655
描述	uncharacterized SmilChr08G002655
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26028874 - 26032258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997292`
GeneID	`130997292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997292`
原始查询	`SmilChr08G002655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836272]; symbol=AT5G61510; hit=AT5G61510; species=arabidopsis; confidence=high
产物	GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836272]; symbol=AT5G61510; hit=AT5G61510; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G61510` (AT5G61510) GroES-like zinc-binding alcohol dehydrogenase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836272] identity=81.8; qcov=0.848; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0101600` - identity=71.5; qcov=0.887; evalue=1.39e-179; confidence=high
GO	GO:0003960 (quinone reductase (NADPH) activity); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0005829 (cytosol); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress)
KEGG	-
Pfam	PF00107 (ADH_zinc_N); PF08240 (ADH_N); PF13602 (ADH_zinc_N_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778543.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.60000	`XP_057778543.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057778543.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778543.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778543.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26029153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A5,B7,B80
`Chr8:26029205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B27,B74,C73
`Chr8:26030618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B27,B74,C73
`Chr8:26030704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:26032031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B99,C87
`Chr8:26032031`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B99,C87
`Chr8:26032081`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,B98,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778543.1

388 aa

194

388

ADH_N

ADH_zinc_N

ADH_zinc_N_2

PF08240 ADH_N 90-172 aa PF00107 ADH_zinc_N 214-322 aa PF13602 ADH_zinc_N_2 248-383 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778543.1`	Pfam	`PF08240`	ADH_N	Domain	90	172	4.7e-15	56.4	Alcohol dehydrogenase GroES-like domain
`XP_057778543.1`	Pfam	`PF00107`	ADH_zinc_N	Domain	214	322	8.7e-25	87.9	Zinc-binding dehydrogenase
`XP_057778543.1`	Pfam	`PF13602`	ADH_zinc_N_2	Domain	248	383	4.7e-18	67.1	Zinc-binding dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922560.1
AGAAAGAAGTGCACTCTTGTGGGTGGAGGAGTATATTTTTTTGAGCATAATTCGGAGTTGGTAGATGCAAAGTCGTGGTCAGTGGCGTCATCAATTTTGTTCCGCCCCATTTCATTTAACTTAATGGACTGACCACTCCACAAAACCATGGTCTTGCTCCCACCTTCCAAATTCACTGCCAAATTCCACCATCACCGCTCGCTTCTACACAATTCCTTGCTTACGTGGGGCTTTTCATCTCTCAATCGCCGTCCATCGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997292
ATGGTCTTGCTCCCACCTTCCAAATTCACTGCCAAATTCCACCATCACCGCTCGCTTCTACACAATTCCTTGCTTACGTGGGGCTTTTCATCTCTCAATCGCCGTCCATCGCCCTTTACCAGAACTATCCCTTCAGCTTTTGGACTACAAGTTGGAACACTTAGGCCCATCTCTTGTTCATCAAACATGATCAAAGCGATCAGAGTAAATGAACTCGGAGGCCCTGAGGTTCTGAAATGGGAGGATGTGGAACTGGGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778543.1
MVLLPPSKFTAKFHHHRSLLHNSLLTWGFSSLNRRPSPFTRTIPSAFGLQVGTLRPISCSSNMIKAIRVNELGGPEVLKWEDVELGEPKEGEIKVKNKAIGLNFIDVYFRKGVYKAPTMPFTPGMEAVGVVTAVGPGLTGRVVGDLVAYAGNPMGAYAEEQILPADKVVPVPPSIDPVVAASILLKGMTAQFLVRRCFQVEPGHTVLVHAAAGGVGSLLCQWAYALGATVIGTVSTKEKAAQAKEDGCHHALLYEEDFVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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