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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002656`

染色体: Chr08 坐标: 26036495-26040519 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002656`
名称	SmilChr08G002656
描述	expansin-B15-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26036495 - 26040519 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997293`
GeneID	`130997293`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997293`
原始查询	`SmilChr08G002656`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-B15-like
产物	expansin-B15-like
Arabidopsis	`AT1G65680` (EXPB2) expansin B2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842879] identity=55.6; qcov=0.88; evalue=1.99e-94; confidence=high
Rice	`Os05g0246300` (EXPB18) - identity=53.5; qcov=0.975; evalue=3.31e-97; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0019953 (sexual reproduction)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997293

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.80000	`XP_057778545.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057778545.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778545.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778545.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26036775`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	A15
`Chr8:26036775`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	A15
`Chr8:26036859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:26040237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778545.1

276 aa

138

276

DPBB_1

Expansin_C

PF03330 DPBB_1 89-165 aa PF01357 Expansin_C 178-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778545.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	89	165	5.8e-17	62.4	Lytic transglycolase
`XP_057778545.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	178	260	1.8e-27	96.0	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922562.1
GTATTAACCATAGATCCTCAATAAATCTATAGAAGAAAGTAATGTCACTTCGCAACAAGTAACAACGACATCCAGGCCAAAAGGTGATGTATGCATAATATAAAGCGTTAAGTTTTTGCTAATGCAATAGTTGCTGGTATTCACTATAAATACCAAACAAAATTATGAGCAAGTAACTAAACTAAATTCTCAGAGCCATTGTTTCATTTACAATTTTGTTGGTCACAACCTTTATCTAGCTTGGTGAAATGACAGTAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997293
ATGACAGTAAGGTTAGGTCGTGAAATTTGTAAGCCACATTGGCTACTGACAAATTTAGTTGTATTGTTTTTTATGTGCAAAATATGCCAAAGCTTCAAACATGTACACAAGCATTTCAACTCGTCCGGGAAAGCTTTGCACTGGTCGTCTGCTGGCGCAACGTGGTACGGAAGCCCTAACGGTGCTGGAAGTGACGGAGGAGCGTGTGGTTACGGAAACCTTGTATCAGAAGTTCCATTTGCTTCCATGGTGACCGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778545.1
MTVRLGREICKPHWLLTNLVVLFFMCKICQSFKHVHKHFNSSGKALHWSSAGATWYGSPNGAGSDGGACGYGNLVSEVPFASMVTGIGPSLYKSGKECGACYMIKCRKHPSCSRKMVRVVITDFCPGGVCLSDAAHFDLSGTAFGAMAVPGQQDKLRDAGMLQIRFARAPCDYSGKKIAFHVDQGSNPNYMAVVIEYEEGDGDLRRVDVQQASSSDWLEMKQSWGAVWQLNPGFELRPPLSIRLTSHYSLQTLVAKNVIP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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