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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002660`

染色体: Chr08 坐标: 26074041-26075779 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002660`
名称	SmilChr08G002660
描述	uncharacterized SmilChr08G002660
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26074041 - 26075779 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997296`
GeneID	`130997296`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997296`
原始查询	`SmilChr08G002660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820167]; symbol=AT3G10060; hit=AT3G10060; species=arabidopsis; confidence=low
产物	FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820167]; symbol=AT3G10060; hit=AT3G10060; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G10060` (AT3G10060) FKBP-like peptidyl-prolyl cis-trans isomerase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820167] identity=65.1; qcov=0.439; evalue=4.96e-10; confidence=low
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997296

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778548.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778548.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778548.1`
4	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057778548.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778548.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26074516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B23,B78,B82,B91,D5
`Chr8:26074732`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B125,B32,B40,C26
`Chr8:26074732`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B125,B32,B40,C26
`Chr8:26074735`	`AG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B112,B81
`Chr8:26074745`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	B123,B133,B31,B34,B44,B69,B85,B97,C18,C43,C82
`Chr8:26074757`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	B123,B133,B3,B34,B44,B69,B81,B85,C18,C43
`Chr8:26074767`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	156	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A18,A20,A24,A25,A3,A4,A5,A6,B101,B103,B104,B105,B106,B107,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B122,B124,B127,B129,B130,B131,B135,B15,B16,B17,B18,B19,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B3,B31,B32,B34,B38,B4,B41,B42,B45,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B53,B54,B55,B56,B58,B59,B6,B62,B63,B65,B66,B68,B70,B71,B73,B75,B78,B79,B80,B83,B85,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B98,C1,C11,C12,C15,C16,C19,C2,C20,C21,C22,C26,C27,C28,C29,C32,C34,C35,C36,C4,C40,C41,C42,C45,C46,C47,C48,C49,C50,C52,C53,C54,C55,C57,C59,C60,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C78,C79,C8,C81,C84,C86,C87,C9,D10,D3,D4,D5,D6,D9
`Chr8:26074771`	`T`	`TAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	11	B123,B3,B31,B34,B44,B69,B85,B97,C18,C43,C82
`Chr8:26074934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B114,B120,B85,C82
`Chr8:26074934`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B120,B85,C82
`Chr8:26075076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B60
`Chr8:26075244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093037.1
AGAATATCAAATCCCTAAGTTCCTAACTCTCTCTCTCGATCGAGCACCTCCTCCGCCCCCAGTCCGCTGCGCCGCCTCCCTCGGTCCGACTCACCTCCGGCAGCCTCCCTCTGGTCCGTCCCCCGATCTGACTCCGTCTGCCCCACCCCGTAATCCGCCTCTACCTCTCATCAAATCCTCCGCCCCATCAAATGGAGACTTAAATCGAGCCCTAATATCCCAACCCTCTGCAATCGACCGTGGTCCGAGCATCCACCAAT...

XR_009093036.1
TCTCTCTCGATCGAGCACCTCCTCCGCCCCCAGTCCGCTGCGCCGCCTCCCTCGGTCCGACTCACCTCCGGCAGCCTCCCTCTGGTCCGTCCCCCGATCTGACTCCGTCTGCCCCACCCCGTAATCCGCCTCTACCTCTCATCAAATCCTCCGCCCCATCAAATGGAGACTTAAATCGAGCCCTAATATCCCAACCCTCTGCAATCGACCGTGGTCCGAGCATCCACCAATGCTGCCAGAAGCTGACGCCGTCGACCCCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997296
ATGACTAAGCCTCTGCTCCCATTCCCGGCGGCGAAGCCGGACGAAGCCTCTACTTCCGCTCCACACGCTGTCGCACCGACGTTTCTCCATCTCTTGTCTCAGGGTTTAGGCCGATTGCAGCTTTTTGATGAATTTGAAATTGGTGGTGATGGTTGCAGCTTTTTGATAAATCAACGGGCTGAGAGGAGCAAAAATTCTGAAAATGAATTCAAAACCCTCCCAAATGGTCTCAAGTACTATGATTTGAAGACTAGAGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778548.1
MTKPLLPFPAAKPDEASTSAPHAVAPTFLHLLSQGLGRLQLFDEFEIGGDGCSFLINQRAERSKNSENEFKTLPNGLKYYDLKTRDGLEAVKGSRVIV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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