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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002662`

染色体: Chr08 坐标: 26112228-26122465 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002662`
名称	SmilChr08G002662
描述	ceramide kinase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26112228 - 26122465 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997298`
GeneID	`130997298`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997298`
原始查询	`SmilChr08G002662`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ceramide kinase
产物	ceramide kinase
Arabidopsis	`AT5G51290` (ACD5) Diacylglycerol kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835203] identity=54.9; qcov=0.977; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0656200` (OsCERK) - identity=45.8; qcov=0.623; evalue=2.71e-95; confidence=high
GO	GO:0016301 (kinase activity)
KEGG	smil00600 (Sphingolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00781 (DAGK_cat)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997298

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057778551.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778551.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057778551.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057778551.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778551.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26112445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:26112556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B57,B76,B77,C19,C8
`Chr8:26114361`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:26114825`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:26116719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,B95
`Chr8:26116990`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C36
`Chr8:26116990`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C36
`Chr8:26116992`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr8:26118599`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D11
`Chr8:26118599`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26119555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B55,B88
`Chr8:26120344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778551.1

616 aa

308

616

DAGK_cat

PF00781 DAGK_cat 173-255 aa

XP_057778552.1

613 aa

306

613

DAGK_cat

PF00781 DAGK_cat 170-252 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778551.1`	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	173	255	1.7e-20	73.6	Diacylglycerol kinase catalytic domain
`XP_057778552.1`	Pfam	`PF00781`	DAGK_cat	Family	170	252	1.7e-20	73.6	Diacylglycerol kinase catalytic domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922569.1
AAAGAGGGAATAGAGAAACAACGAAGAAAATGAGGTCGCAATAAACCAAATTACAGATCACACATTCGACTGTATTCTGATCATGTAACACTAATCCTAACATCGTTTTACCTTAATTTGATTGCTTCCAAAAAAATTAGTTCGAAACACTTAAAACAGCAGTCCCTAATTATTCAAAAGAAATATATCATGGATGAAAACGAAAATGGGTTTATGGGAGTTAATTCCTTGACTCCCCCAAATCCAGATTTTACTGATGG...

XM_057922568.1
TAGAGAAACAACGAAGAAAATGAGGTCGCAATAAACCAAATTACAGATCACACATTCGACTGTATTCTGATCATGTAACACTAATCCTAACATCGTTTTACCTTAATTTGATTGCTTCCAAAAAAATTAGTTCGAAACACTTAAAACAGCAGTCCCTAATTATTCAAAAGAAATATATCATGGATGAAAACGAAAATGGGTTTATGGGAGTTAATTCCTTGACTCCCCCAAATCCAGATTTTACTGATGGCGATGAGCCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997298
ATGGATGAAAACGAAAATGGGTTTATGGGAGTTAATTCCTTGACTCCCCCAAATCCAGATTTTACTGATGGCGATGAGCCCTCCGTTTCTGGCTGCAACTTTTTATTGGATCGCACTGGAGAAGTCGTTCTTACGCATACTTCAGATGGATTGTCATGGAAACTGGTTGATTCTTCGAATGATGAAGGGGATAAGTTTTCTTGTCTGGGATTCAAACTTGTTTCAAATACAGAAATCGAGGTCAATATTGCTGATGTTTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778551.1
MDENENGFMGVNSLTPPNPDFTDGDEPSVSGCNFLLDRTGEVVLTHTSDGLSWKLVDSSNDEGDKFSCLGFKLVSNTEIEVNIADVYAVNFIGWGLVHESALASLEVSLLDRSSEVKHMYRFAIHVVHKSKTQSSLWTPSVYTFGHKNLEICMSWVNQINSHLHVEVKRPKNLLVLVHPRSGKGHGCKIWETVAPLFSQAKVKTKVIVTERAGHARDILSSITNRELSLYDGVVAVGGDGFFNEILNGVLLSRHRAPYPP...

XP_057778552.1
MDENENGFMGVNSLTPPNPDFTDGDEPSVSGCNFLLDRTGEVVLTHTSDGLSWKLVDSSNDEGDKFSCLGFKLVSNTEIEVNIADVYAVNFIGWGLVHESALASLEVSLLDRSSEMYRFAIHVVHKSKTQSSLWTPSVYTFGHKNLEICMSWVNQINSHLHVEVKRPKNLLVLVHPRSGKGHGCKIWETVAPLFSQAKVKTKVIVTERAGHARDILSSITNRELSLYDGVVAVGGDGFFNEILNGVLLSRHRAPYPPAPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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