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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002664`

染色体: Chr08 坐标: 26131595-26132934 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002664`
名称	SmilChr08G002664
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1B, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26131595 - 26132934 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997299`
GeneID	`130997299`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997299`
原始查询	`SmilChr08G002664`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CURVATURE THYLAKOID 1B, chloroplastic
产物	protein CURVATURE THYLAKOID 1B%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G46820` (PSI-P) photosystem I P subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819295] identity=58; qcov=0.794; evalue=4.54e-41; confidence=medium
Rice	`Os07g0469100` - identity=47.9; qcov=1.02; evalue=8.66e-40; confidence=medium
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009579 (thylakoid)
KEGG	-
Pfam	PF14159 (CAAD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997299

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778553.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057778553.1`
3	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	1.00000	`XP_057778553.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057778553.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778553.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26131892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A5,B7,B80
`Chr8:26132188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778553.1

165 aa

165

CAAD

PF14159 CAAD 80-163 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778553.1`	Pfam	`PF14159`	CAAD	Domain	80	163	3.9e-27	94.6	CAAD domains of cyanobacterial aminoacyl-tRNA synthetase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922570.1
TTGGAATACCAAAACGTTTGGTCTATGATCAACCCAATATACATTAATTTCCTCCAAAATAAATCGTCCATTTTCGCAATGGGAAGAAACCCAATAGTAGTATTTGTTTCGATTAAGCAGTTGCAAACAGGGACCTGAAATATTTTATCCATTACATCACCATAAAATGGCTATCCGACTGCCACGCCATCAAACGACATATCCAAAAGATTCGTACGAGTGGTATTGGTGAGTCCAAGCTTTTTCAATTTCTTTTAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997299
ATGGCCTCAACAACATGCACCCCTCTCTCTCTTTCTTCTTCATCCAAGGCTCCTCCTCGTCTTCAACCACCAGCAGCCGCCCAATGCGTCGCGGTGGCTCCTCCTCCTCTCGCCAAGACCACGTCCTACCGGCCTGCAGGTAGGAAGATCGGGCGGAATGTGGCGGCCATGGCTACTGGAGAGGCGTCGGCTGAAGTGGTTAATGTTGGCAGCGCTGAGACTCCAGAAATAGTTGAAAAAATTCAGCAAGCCTGGGAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778553.1
MASTTCTPLSLSSSSKAPPRLQPPAAAQCVAVAPPPLAKTTSYRPAGRKIGRNVAAMATGEASAEVVNVGSAETPEIVEKIQQAWEKVEDKYAVTSLVVAGAIGLVACAGVISAIDKLPLIPGVLELVGIGYTGYFAYRNLASKPNRDALIQKIKGTYNDVIGSS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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