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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002683`

染色体: Chr08 坐标: 26410731-26413137 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002683`
名称	SmilChr08G002683
描述	cytochrome P450 78A9-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26410731 - 26413137 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997315`
GeneID	`130997315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997315`
原始查询	`SmilChr08G002683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome P450 78A9-like
产物	cytochrome P450 78A9-like
Arabidopsis	`AT3G61880` (CYP78A9) cytochrome p450 78a9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825361] identity=63.7; qcov=0.935; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0547300` - identity=57.4; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	-
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057778575.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057778575.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778575.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778575.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778575.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26411125`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B29,B87,C59
`Chr8:26411168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:26411442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C6
`Chr8:26412078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B124,B22,B91
`Chr8:26412420`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C23
`Chr8:26412420`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C23
`Chr8:26412711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B63,B8,C51,C57
`Chr8:26412725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:26412787`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:26412830`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B87
`Chr8:26412830`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B87
`Chr8:26412935`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	B112,B120,B17,B51,C35,C37,C57,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778575.1

527 aa

264

527

p450

PF00067 p450 69-495 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778575.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	69	495	9.3e-75	252.9	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922592.1
CCCACGCTCACCTGTAACATATAAGTAGAATAGTGGTGAAATAAAATAATTGGGTGAGTCCTAAGTGGTAACAGTAAAAGAATTGTTGACTGATTAATATTTCCTGGCTTCCTCACTATATAAACGAGCTTATGCCGTCCTAGTTTCAACCTCAAAAGCAACAAACCTTTTCTGCATATTTCTTCTTCTTCTTAATTAAAAATGATGAACACAGACGTTGAGAGCCTGTGGATCTTCGCTCTGGCTTCGAAATGTCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997315
ATGATGAACACAGACGTTGAGAGCCTGTGGATCTTCGCTCTGGCTTCGAAATGTCAATCTCTCTCTCCCTTCAACACCATCGCCTTGGCATTCCTGGCTCTCCTCTCATGTATAACCATCAACCTGATCGTCTGGTCCCACCCCGGCGGCCCAGCTTGGGGCGCCTACAAATGGCGGCGGCGCAATTCGAATTCTCCCCCGATTCCGGGGCCGAGGGGCCTCCCCGTGATCGGCAGCATGGACCTGATGATGGGTCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778575.1
MMNTDVESLWIFALASKCQSLSPFNTIALAFLALLSCITINLIVWSHPGGPAWGAYKWRRRNSNSPPIPGPRGLPVIGSMDLMMGLAHRKIAAAAASCGAKRLMAFSLGQTRAVVTCNPEVAREILNSGTFSDRPVKESAYHLMFNRSIGFAPYGVYWTALRKMAAQHLFCPRQVRAAEKQRLDIANQVAALLAASQSGGGGVRVRDALKVASLNNMMCSVFGSAGADAAELHDLVEQGYHLLGLINWSDHLSFLADLDL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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