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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002687`

染色体: Chr08 坐标: 26479454-26480477 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002687`
名称	SmilChr08G002687
描述	ATP synthase delta chain, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26479454 - 26480477 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997319`
GeneID	`130997319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997319`
原始查询	`SmilChr08G002687`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase delta chain, chloroplastic
产物	ATP synthase delta chain%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT4G09650` (ATPD) F-type H+-transporting ATPase subunit delta [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826551] identity=19.9; qcov=0.681; evalue=4.75e-12; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	GO:0009535 (chloroplast thylakoid membrane); GO:0009772 (photosynthetic electron transport in photosystem II); GO:0009773 (photosynthetic electron transport in photosystem I); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0045261 (GO:0045261); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00213 (OSCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778578.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057778578.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778578.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778578.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778578.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26479679`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:26479952`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26480142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:26480244`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	A2,A5,B7,B80,C81
`Chr8:26480244`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	A2,A5,B7,B80,C81
`Chr8:26480300`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B76
`Chr8:26480300`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B76
`Chr8:26480306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B71,B89

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778578.1

229 aa

114

229

OSCP

PF00213 OSCP 83-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778578.1`	Pfam	`PF00213`	OSCP	Family	83	226	2e-16	61.3	ATP synthase delta (OSCP) subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922595.1
TGCTTGAATGAATTTTATGTTCTTTTTTGCCTTAAAACAATGGAAGATGTCATATAATTAACTTATGAAAATTACCAACCCAATTCTTTTAGCATAAGTATTTATAAAATTTTCCCATTTTAATATTTGTGGAGTATATTTCTTGTCACAAGTACAACCTCCCAAATTATCCAAACTTTTCTCATTCCCATCCAAACCCAAGCAAGCCATGGACACCCTCTCAACCTCCATCTCCACATTCACCATCCCCCAATCCAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997319
ATGGACACCCTCTCAACCTCCATCTCCACATTCACCATCCCCCAATCCAATCTCAAAACCCACCTCCATCACCACCACCCCTCAATCCCCTCCACCACCAAACCCAAAACGACCAAACTCTCAAACAAAACCAGCGTCACTTTCACAACCCAAAACCACTTCGTCGCTCCTCACATCAGCTCATCTCGATCATCCTCGCCGCTCAAACACTCCCCCAACTCCAAGCCCCACCACAGCCCATCCACCGGCTACGCCGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778578.1
MDTLSTSISTFTIPQSNLKTHLHHHHPSIPSTTKPKTTKLSNKTSVTFTTQNHFVAPHISSSRSSSPLKHSPNSKPHHSPSTGYAVALLDAARRHNAVDAVSRDVRRLSRWLRNDQLRGVMGDPLTDKAAKGEIVKEVVRQGRFEKHLVKLVKLLAEKAKVDLLGQVLSEFGKIYDELSVCSNHQVLLLPYGMKMKMEENKILEIIGRVQRVTGADKVTVRELLDPRFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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