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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002693`

染色体: Chr08 坐标: 26532723-26536534 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002693`
名称	SmilChr08G002693
描述	serine/threonine-protein kinase WNK8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26532723 - 26536534 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997324`
GeneID	`130997324`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997324`
原始查询	`SmilChr08G002693`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase WNK8-like
产物	serine/threonine-protein kinase WNK8-like
Arabidopsis	`AT3G18750` (WNK6) with no lysine (K) kinase 6 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821406] identity=61.6; qcov=0.616; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0672800` (OsWNK4) - identity=49.8; qcov=0.918; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004674 (protein serine/threonine kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0035556 (intracellular signal transduction)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF12202 (OSR1_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997324

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778590.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778590.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778590.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778590.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778590.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26533097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:26533231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr8:26533238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B87,C59
`Chr8:26533282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B13
`Chr8:26533299`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:26533512`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:26533519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,D11
`Chr8:26533756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B106,B35,B57,B61,D10
`Chr8:26534367`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	164	A1,A11,A13,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A3,A4,A5,A7,A9,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B125,B126,B127,B13,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B14,B140,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B28,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B39,B4,B40,B41,B43,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B63,B65,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B77,B80,B83,B84,B85,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:26534373`	`A`	`ACT`	2bp_insertion	frameshift_variant	175	A1,A11,A13,A15,A18,A19,A2,A21,A23,A24,A3,A4,A5,A7,A9,B100,B101,B102,B103,B106,B107,B108,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B119,B120,B122,B125,B126,B127,B13,B131,B132,B133,B134,B136,B138,B139,B14,B140,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B24,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B47,B48,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B59,B60,B61,B63,B65,B68,B69,B71,B72,B73,B75,B77,B80,B82,B83,B84,B85,B88,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C1,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C31,C33,C34,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C52,C53,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C8,C82,C83,C85,C87,C9,D10,D11,D2,D4,D5,D6,D7,D8
`Chr8:26534407`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr8:26534419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778590.1

680 aa

340

680

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

OSR1_C

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 75-324 aa PF00069 Pkinase 76-330 aa PF12202 OSR1_C 407-463 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778590.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	75	324	2.5e-39	135.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057778590.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	76	330	4.4e-56	190.9	Protein kinase domain
`XP_057778590.1`	Pfam	`PF12202`	OSR1_C	Domain	407	463	9.8e-06	26.3	Oxidative-stress-responsive kinase 1 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922607.1
GCACTTATTTCCGCCTCGAAATTCATATAAATGATCTCCATCAAATCAAATTTAATTTTCTTCTCAAAAAAATTCCCATTAACCCCGCCTACCAAAAACAAAATAAGCTTCTATTTCCTGGATGCATTTTCCCCCTTTTTGGCTCCAAAAGCATGATTACCGAAAACGAAAAATCAGCGTAGATGCTGATTAAGACATTCAATCAAGATCCGCAGCAATGCTATTGAAGATTCATCGCCACTCGACGTTTACGCGAATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997324
ATGACCGGAATGAGTTCAGGTGCGGGCTTGAGATCAGGCTCGGGCTCGGCCGTGCGGATGAGTTCGGGCTCGGGCTTGGGATCGCCGCATCCAATCCTAAGCGGAAGTGGGAATGTTGAAGCCCAAGGTATTTTGCCGTCACCAAGTTCTGCTCGTGTCAATGAGGCTCGTTACCGCGAGTTCGAATTTGTGGAGAAATGCACCAGAAGTCGATATGCTCGGTATGATGAAGTTTTGGGCAAGGGTGCATTCAAGACTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778590.1
MTGMSSGAGLRSGSGSAVRMSSGSGLGSPHPILSGSGNVEAQGILPSPSSARVNEARYREFEFVEKCTRSRYARYDEVLGKGAFKTVYKAFDQLDGIEVAWNRVKITDMLQSPEDLEKLYSEVHLLRQLKHVNIIKLYDAWIDDKKKTINMITELFTSGSLRQFRKRHKSVNMKAIKSWARQILQGLDYLHSQNPPVIHRDLKCDNIFVNGNQGEVKIGDLGLATIMQQPKAKSVIGTPEFMAPELYEEEYNELVDIYSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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