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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002694`

染色体: Chr08 坐标: 26538696-26541035 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002694`
名称	SmilChr08G002694
描述	uncharacterized SmilChr08G002694
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26538696 - 26541035 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998255`
GeneID	`130998255`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998255`
原始查询	`SmilChr08G002694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os02g0508500; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=29; qcov=0.603; evalue=1.22e-33; confidence=low
Rice	`Os02g0508500` - identity=35.4; qcov=0.6; evalue=5.12e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998255

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779669.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779669.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779669.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779669.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779669.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26539425`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:26539425`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:26539446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr8:26539470`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B78,C45,C80,D4
`Chr8:26539477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:26539515`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B102,B121,B32,B40,B48,B54,B68,B89,C26,C36,C48,C87,D4
`Chr8:26539568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B101,B111,B128,B13,B133,B4,B51,B52,B56,B78,B96,C44,C63,C67,C83
`Chr8:26539705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,B139,C4
`Chr8:26539712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C62
`Chr8:26539751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B15,B32
`Chr8:26539751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,B32
`Chr8:26539807`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779669.1

423 aa

212

423

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 124-185 aa PF10551 MULE 320-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779669.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	124	185	2.8e-12	46.8	MuDR family transposase
`XP_057779669.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	320	372	2.5e-07	31.7	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923686.1
ATCCTGGCGATTTCAATCTCTAATTGCGCATATTCCAATCCCTTCAGAGTTCGATCATTCAAGCTTCGATTTCAGACTTAAAATTCTGGCGATTTTGTACAACATCGATCATCGGCTTCAAAGTGTGTTGTTTGTCATTCTTTTATGCGACACGTAGCAGACATATTGGTCCTCACTTTTCAAGGTTCAAAGACGCATCAGCATGAGTTTCCCTGATCTAATCACTGTTAGAGTGCATTTTGGTGGAAAATTTGAGGGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998255
ATGGAAAATGTATGTCTTGATATTTATGTTGAGTGTAGGAGTTTAGGTGATGATATTGATGATGCTTTGGATCCTAATGATGGGTTTAATGATTTTGATGTTGATGGTGGGAAGCATATGAATACTAAGGAGGGTATGGAAGGTTTGGAGGCTTTAGAACCCAATTATGGGAAGGGTTTGGAGGGCTTGCAAACTGATTGTGTTCAGGATATGGAGAACGAAATAGGTATGAGAAATTCAAATGAGGGTTGGGATGTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779669.1
MENVCLDIYVECRSLGDDIDDALDPNDGFNDFDVDGGKHMNTKEGMEGLEALEPNYGKGLEGLQTDCVQDMENEIGMRNSNEGWDVSEYEKSDDSIYEVEDAKKIGDMEKKLQYNKECDHKKLKLQLGMRFTDVAECKDAVKLWAIVNGHNIKWVKSEEYRIQAKCEPGCPWKLYASKLTREPTCVIKRYVGKHECVRPIHHRQVTSVWIANHFLERLKTNPMLKALELQRELIKKYQVRAPLLKCYRAKKKAMDILHVT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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