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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002707`

染色体: Chr08 坐标: 26634468-26639253 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002707`
名称	SmilChr08G002707
描述	bifunctional fucokinase/fucose pyrophosphorylase
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26634468 - 26639253 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997336`
GeneID	`130997336`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997336`
原始查询	`SmilChr08G002707`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	bifunctional fucokinase/fucose pyrophosphorylase
产物	bifunctional fucokinase/fucose pyrophosphorylase
Arabidopsis	`AT1G01220` (FKGP) L-fucokinase/GDP-L-fucose pyrophosphorylase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839420] identity=69.7; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0115100` (OSJNBa0090O10.21) - identity=63.7; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0042352 (GDP-L-fucose salvage); GO:0050201 (fucokinase activity)
KEGG	smil00520 (Amino sugar and nucleotide sugar metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01250 (Biosynthesis of nucleotide sugars - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00288 (GHMP_kinases_N); PF07959 (Fucose_pyrophosphorylase); PF08544 (GHMP_kinases_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997336

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778611.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778611.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778611.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778611.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778611.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26634637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:26634757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B5
`Chr8:26635588`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B34,B37
`Chr8:26635588`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B34,B37
`Chr8:26635935`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:26636208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:26636922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,B37
`Chr8:26637016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:26637054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:26637102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:26637242`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B17,D1
`Chr8:26637434`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,C13,C39,C83,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778611.1

1068 aa

534

1068

Fucose_pyrophosphorylase

GHMP_kinases_N

GHMP_kinases_C

PF07959 Fucose_pyrophosphorylase 137-547 aa PF00288 GHMP_kinases_N 820-893 aa PF08544 GHMP_kinases_C 974-1047 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778611.1`	Pfam	`PF07959`	Fucose_pyrophosphorylase	Domain	137	547	4e-115	385.8	Fucose pyrophosphorylase domain
`XP_057778611.1`	Pfam	`PF00288`	GHMP_kinases_N	Domain	820	893	4.4e-13	50.0	GHMP kinases N terminal domain
`XP_057778611.1`	Pfam	`PF08544`	GHMP_kinases_C	Domain	974	1047	3.3e-07	31.3	GHMP kinases C terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922628.1
TCATACCATTCTCTCTTTTTATTTCATTTTACCGCAACTATCTATATTGACTGAAATCAGATTTCCCGCAGAAATTCACCACCCAGCTGTCGCTAGCTCACCGCAGATTCGTAACTATGTCGGAGAGCCGGTCGCGGCGGAGCTCAGCCCAATCCAAGGCTGACCTCTCGGCGTCGCTGCGGCGCGCTTGGTACCATTTGAGGCTGTCGGTCCGTGATCCGACTCGGGTGCGCACTTGGGACGCCGTCGTTTTGACGGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997336
ATGTCGGAGAGCCGGTCGCGGCGGAGCTCAGCCCAATCCAAGGCTGACCTCTCGGCGTCGCTGCGGCGCGCTTGGTACCATTTGAGGCTGTCGGTCCGTGATCCGACTCGGGTGCGCACTTGGGACGCCGTCGTTTTGACGGCAGCTAGCCCTGAGCAAGCCGAGCTCTACAACTGGCAGCTCAACCGCGCCAAGAGAATGGGCCGCATTGCGCCATCCACCGTCACTCTCGCCGTTCCTGACCCCGACGGCCAGCGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778611.1
MSESRSRRSSAQSKADLSASLRRAWYHLRLSVRDPTRVRTWDAVVLTAASPEQAELYNWQLNRAKRMGRIAPSTVTLAVPDPDGQRIGSGAATLNAIFALAKHLHHLDSAMSGMSDCSSTSSISKSSSEIPLLSLVEVIKKKHVLLLHAGGDSKRVPWANPMGKVFLPLPYLAADDPDGPVPLLFDHILAIASCARQDFQNKGGMFIMTGDVLPCFDAFSMVLPEDTASIVTVPITLDIASNHGVIVASKCESTNANSQV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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