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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002750`

染色体: Chr08 坐标: 27155976-27158658 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002750`
名称	SmilChr08G002750
描述	uncharacterized SmilChr08G002750
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27155976 - 27158658 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998262`
GeneID	`130998262`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998262`
原始查询	`SmilChr08G002750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0597300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=26.7; qcov=0.601; evalue=8.34e-48; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=30.1; qcov=0.724; evalue=9.14e-60; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998262

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779677.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779677.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779677.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779677.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779677.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27155977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr8:27155977`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C4
`Chr8:27155984`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B7
`Chr8:27155993`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B14,C49,C70
`Chr8:27155993`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B14,C49,C70
`Chr8:27156025`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	B135,B58,B60,B73,B85,C13,C21,C29,C34,C68,C83,D6
`Chr8:27156060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:27156072`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B62,C27
`Chr8:27156104`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B29,B91
`Chr8:27156113`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B129,B29,B91
`Chr8:27156118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B112,B124,B26,B46
`Chr8:27156120`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B110,C32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779677.1

803 aa

402

803

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 420-513 aa PF00872 Transposase_mut 437-588 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779677.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	420	513	4.1e-19	69.5	MULE transposase domain
`XP_057779677.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	437	588	1.5e-09	37.9	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923694.1
ATGGAATTCGTGAGATACGTATATGTGAGATACAATGGAGCCGTCGATGGTATATACTACGTTGGCGGGGATACAGAGGTTCTTCCCCTCTTCAACGAAACTATTGCAAGCCTGATGTACAGCATCAACAATATTATGATGACGCATTCGATGAGCCCGAACTACCAATTGTATTATTTGGCGACCAATCGATTTGGCCGAGAGACGAAATGTGGCTTGACCACCGACGATGACGTGGAAGGCTTGTTGAAAACTGCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998262
ATGGAATTCGTGAGATACGTATATGTGAGATACAATGGAGCCGTCGATGGTATATACTACGTTGGCGGGGATACAGAGGTTCTTCCCCTCTTCAACGAAACTATTGCAAGCCTGATGTACAGCATCAACAATATTATGATGACGCATTCGATGAGCCCGAACTACCAATTGTATTATTTGGCGACCAATCGATTTGGCCGAGAGACGAAATGTGGCTTGACCACCGACGATGACGTGGAAGGCTTGTTGAAAACTGCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779677.1
MEFVRYVYVRYNGAVDGIYYVGGDTEVLPLFNETIASLMYSINNIMMTHSMSPNYQLYYLATNRFGRETKCGLTTDDDVEGLLKTAEYPMVYVEHINGSVEEAYIPSVDFAHPSGHEYESQSSQYETSYHDTSYHDGQSSLPTQYFSWDGQPLDESAWNQTESLNEMCGRFKQVRTDEDPNDEDEEPEDDAEDPDDDSDKDDEEYDPANESSTDSNASEDLLDDDLIEFTAAERAEELVLAVGLWNMKQGTEAKVDRSDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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