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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002752`

染色体: Chr08 坐标: 27177960-27180895 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002752`
名称	SmilChr08G002752
描述	uncharacterized SmilChr08G002752
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27177960 - 27180895 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997378`
GeneID	`130997378`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997378`
原始查询	`SmilChr08G002752`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	B3 DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719334]; symbol=AT3G28853; hit=AT3G28853; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	B3 DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719334]; symbol=AT3G28853; hit=AT3G28853; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G28853` (AT3G28853) B3 DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28719334] identity=33.6; qcov=0.277; evalue=1.79e-06; confidence=weak
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF31239 (At5g26805_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997378

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778649.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778649.1`
3	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057778649.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778649.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778649.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27178702`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:27178741`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr8:27178770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:27179059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B17,B22,D1
`Chr8:27179234`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B54,B55,B57,B67,B94,C6
`Chr8:27179287`	`ATT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	63	A10,A18,A19,B10,B106,B111,B115,B12,B123,B130,B135,B136,B16,B19,B21,B23,B34,B39,B42,B44,B46,B48,B54,B55,B57,B59,B6,B60,B62,B64,B67,B68,B69,B74,B75,B8,B86,B89,B95,B98,B99,C14,C24,C3,C30,C32,C4,C45,C48,C49,C51,C6,C62,C64,C69,C71,C73,C78,C9,D10,D3,D4,D8
`Chr8:27179292`	`G`	`GCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	63	A10,A18,A19,B10,B106,B111,B115,B12,B123,B130,B135,B136,B16,B19,B21,B23,B24,B34,B39,B42,B44,B46,B54,B55,B57,B59,B6,B60,B62,B64,B67,B68,B69,B74,B75,B8,B86,B89,B95,B98,B99,C14,C24,C3,C30,C32,C4,C45,C48,C49,C51,C6,C62,C64,C69,C71,C73,C78,C9,D10,D3,D4,D8
`Chr8:27179649`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	20	A9,B114,B130,B135,B14,B46,B6,B60,B75,B79,B83,C12,C20,C25,C5,C51,C54,C63,C66,C85
`Chr8:27179656`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A9,B114,B130,B135,B14,B46,B6,B60,B75,B79,B83,C12,C20,C25,C5,C51,C54,C63,C66,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778649.1

375 aa

188

375

At5g26805_C

PF31239 At5g26805_C 17-122 aa PF31239 At5g26805_C 147-252 aa PF31239 At5g26805_C 267-370 aa

XP_057778650.1

375 aa

188

375

At5g26805_C

PF31239 At5g26805_C 17-122 aa PF31239 At5g26805_C 147-252 aa PF31239 At5g26805_C 267-370 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778649.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	17	122	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain
`XP_057778649.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	147	252	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain
`XP_057778649.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	267	370	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain
`XP_057778650.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	17	122	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain
`XP_057778650.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	147	252	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain
`XP_057778650.1`	Pfam	`PF31239`	At5g26805_C	Domain	267	370	3.4e-41	140.9	B3 domain-containing protein At5g26805, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922666.1
ATGTAATTTCTTGTCCACCTCCTCAATTCACATTCACATACACACCCACTTCTCCTTCCCCATCTCATATTTCTCGTTCAAAATCAAACGGGGCGTCCACCTCCCCTTCACCTACTCATCAACACCCCCTTCCACCACCTCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCGCTTTTTCTTCCCTCTTCAATGTTCTTCTTCTTCTCTTTCTTGCTTGCTAACCCAGCCGCGACCTCCTAAGCAACACCATTTCAATTTATGAATCCTA...

XM_057922667.1
CCTCCTCAATTCACATTCACATACACACCCACTTCTCCTTCCCCATCTCATATTTCTCGTTCAAAATCAAACGGGGCGTCCACCTCCCCTTCACCTACTCATCAACACCCCCTTCCACCACCTCAGCTGCCGCCGCCGCCGCCGCGCTTTTTCTTCCCTCTTCAATGTTCTTCTTCTTCTCTTTCTTGCTTGCTAACCCAGCCGCGACCTCCTAAGCAACACCATTTCAATTTATGAATCCTATTTGATAATTTCCTCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997378
ATGAAGAGGTCGGCATACTATAATGCGGTTCCTCAGGTGCCAGATCAGTGGCCAATCAAAAAAGCACTCACCCTTTCTGATATTGACATCACCCATCCTTTCCTAACGCTGTCCCGGCAACAAGTTGAAACTAACATCGTAGTGTTCATGACTCCTCAAGATCAGGAAATCTTAAGAGCTGAAGGGCAAGTGGGTTTTAATGCTCAGGACGATGATAATGGCGATATGTATGCGATGAGATTGAAGTGGCGTGGGAGCTA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778649.1
MKRSAYYNAVPQVPDQWPIKKALTLSDIDITHPFLTLSRQQVETNIVVFMTPQDQEILRAEGQVGFNAQDDDNGDMYAMRLKWRGSYYNLIGKWGKVVRGKGLDVGQEIRLRWFNGCLHFSVPQQQIVTVPPPVRLVTAPPLVQDHWPIRKILTSSDVDTTHPFLPLPRKLVEEHILAQWTPQEREKLRKEEQVPINVRDYDTGEIYGLKLRWRGNYYNLVAKWANVIRHKGLGVGQEIRLRWVNNCLYFSVPEERYVTA...

XP_057778650.1
MKRSAYYNAVPQVPDQWPIKKALTLSDIDITHPFLTLSRQQVETNIVVFMTPQDQEILRAEGQVGFNAQDDDNGDMYAMRLKWRGSYYNLIGKWGKVVRGKGLDVGQEIRLRWFNGCLHFSVPQQQIVTVPPPVRLVTAPPLVQDHWPIRKILTSSDVDTTHPFLPLPRKLVEEHILAQWTPQEREKLRKEEQVPINVRDYDTGEIYGLKLRWRGNYYNLVAKWANVIRHKGLGVGQEIRLRWVNNCLYFSVPEERYVTA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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