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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002754`

染色体: Chr08 坐标: 27200654-27201582 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002754`
名称	SmilChr08G002754
描述	ferredoxin-A-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27200654 - 27201582 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997381`
GeneID	`130997381`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997381`
原始查询	`SmilChr08G002754`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ferredoxin-A-like
产物	ferredoxin-A-like
Arabidopsis	`AT1G60950` (FED A) 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842386] identity=70.5; qcov=1.01; evalue=6.37e-68; confidence=high
Rice	`Os08g0104600` (Fd1) - identity=60.4; qcov=0.98; evalue=2.71e-52; confidence=high
GO	GO:0009055 (electron transfer activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0022900 (electron transport chain); GO:0051537 (2 iron, 2 sulfur cluster binding)
KEGG	smil00195 (Photosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00111 (Fer2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997381

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778653.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.60000	`XP_057778653.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778653.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778653.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778653.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27201018`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:27201198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:27201351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778653.1

147 aa

147

Fer2

PF00111 Fer2 61-133 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778653.1`	Pfam	`PF00111`	Fer2	Domain	61	133	2.7e-23	82.4	2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922670.1
TAGATGTAGGTAAGCTAATTTTGAGAATGCTAAAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAGAAGAGATAATGAAAATGATAAAACGTACCACAGAAAGGCGCCACGTAGCGGATGAGCCCTAACCAAACCCACAGACCACACACACTATTTCTACAAAGCCTCTATCCTTTTAATTTCAGGAGATCACAGATTTCCTTTTCATTTGTATTTCCAATTCCCCCACACACACCACACACACTCCCTGTCTCTCTAAACTCTGAGCAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997381
ATGGCAAGCCTCGCAAGCACAATGTTCAGCGCGGCCGTGGTCCCCCGCAAGCCGGCGATGGGCACGACGAGCCTCCGGTCCCTCCCGAACCTGAAGCAGGCGGCTCTCTTCGGGCTGAAATCCGGCGGGCGCAGGGGCGGAGCGACGTGCATGGCGACGTACAAGGTGAAGCTGCTAACTCCGGAGGGAGAGGTGGAGTTCGATTGCGCCGACGACGTGTACATCGTGGACCAGGCGGAGGAGGCCGGGATAGATCTGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778653.1
MASLASTMFSAAVVPRKPAMGTTSLRSLPNLKQAALFGLKSGGRRGGATCMATYKVKLLTPEGEVEFDCADDVYIVDQAEEAGIDLPYSCRAGSCSSCAGKVVSGSVDQSDGSFLDDEQMDSGWVLTCVAYPTSDVVIETHKEEEIA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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