当前解析结果
SmilChr08G002761| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002761 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002761 |
| 描述 | uncharacterized protein At2g27730, mitochondrial-like |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 27242866 - 27245239 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997387 |
|---|---|
| GeneID | 130997387 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997387 |
| 原始查询 | SmilChr08G002761 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | F1F0-ATPase inhibitor protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830353]; symbol=AT5G04750; hit=AT5G04750; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | F1F0-ATPase inhibitor protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830353]; symbol=AT5G04750; hit=AT5G04750; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G04750 (AT5G04750)F1F0-ATPase inhibitor protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830353] identity=61.7; qcov=0.732; evalue=3.66e-16; confidence=low |
| Rice | Os02g0533800- identity=64.2; qcov=0.646; evalue=5.02e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF28671 (UMP2) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997387 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057778658.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778658.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778658.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778658.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778658.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:27243348 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,D6 |
Chr8:27243922 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A7,B40,B81,C65 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778658.1PF28671
UMP2 22-79 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778658.1 |
Pfam | PF28671 |
UMP2 | Family | 22 | 79 | 2e-12 | 48.1 | Mitochondrial uncharacterised protein UMP2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。