当前解析结果
SmilChr08G002767| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002767 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002767 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002767 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 27315951 - 27317352 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130998264 |
|---|---|
| GeneID | 130998264 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998264 |
| 原始查询 | SmilChr08G002767 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os11g0282700; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os11g0282700- identity=26.1; qcov=0.717; evalue=1.47e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998264 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779679.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779679.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779679.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779679.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779679.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:27315977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B104,B108,B23,C32,C8 |
Chr8:27315996 |
A |
AGG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | C39 |
Chr8:27315996 |
A |
AGG |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr8:27316021 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A13,B106,B29,B61,B63,B68,B72,B78,B91,C22,C37,C50,C72 |
Chr8:27316078 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 12 | B1,B102,B11,B115,B117,B124,B127,B35,B48,B90,C28,C40 |
Chr8:27316235 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | C39 |
Chr8:27316235 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr8:27316248 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C35,D11 |
Chr8:27316259 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C39 |
Chr8:27316286 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr8:27316346 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C65 |
Chr8:27316350 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A4 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。