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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002782`

染色体: Chr08 坐标: 27515511-27516912 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002782`
名称	SmilChr08G002782
描述	inositol oxygenase 1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27515511 - 27516912 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997404`
GeneID	`130997404`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997404`
原始查询	`SmilChr08G002782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	inositol oxygenase 1-like
产物	inositol oxygenase 1-like
Arabidopsis	`AT1G14520` (MIOX1) myo-inositol oxygenase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838014] identity=68.7; qcov=0.807; evalue=4.16e-33; confidence=medium
Rice	`Os06g0561000` (OsMIOX) - identity=65.3; qcov=0.867; evalue=3.22e-31; confidence=medium
GO	GO:0005506 (iron ion binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0019310 (inositol catabolic process); GO:0050113 (inositol oxygenase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05153 (MIOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997404

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778679.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057778680.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057778680.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778679.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778679.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27516054`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D8
`Chr8:27516088`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr8:27516433`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:27516454`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	149	A1,A13,A14,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A5,A8,A9,B10,B102,B103,B104,B105,B109,B11,B110,B111,B115,B117,B118,B122,B123,B124,B126,B127,B128,B13,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B137,B14,B15,B16,B18,B2,B20,B21,B22,B24,B25,B29,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B44,B48,B49,B52,B53,B54,B55,B59,B6,B62,B65,B66,B68,B7,B70,B71,B72,B75,B77,B79,B80,B81,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B91,B94,B95,B98,B99,C1,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C27,C28,C29,C31,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C50,C53,C54,C55,C60,C61,C62,C63,C64,C69,C7,C73,C76,C79,C80,C81,C82,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D6
`Chr8:27516508`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B123

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778679.1

100 aa

100

MIOX

PF05153 MIOX 4-73 aa

XP_057778680.1

83 aa

MIOX

PF05153 MIOX 4-72 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778679.1`	Pfam	`PF05153`	MIOX	Family	4	73	5.7e-28	98.9	Myo-inositol oxygenase
`XP_057778680.1`	Pfam	`PF05153`	MIOX	Family	4	72	4e-28	99.4	Myo-inositol oxygenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

5 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093076.1
GGTCGATGTTGACCGATGAACAATTTTATATGAATTTGAAGGGATTATGACGCGGAGAACCAAACAAGAGATATAGTTGAAGAACTCTATCGCCTCAGCCACATCAACCAAACATATGACTTTGTAAGAATATTAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAATGTGCAGTGTATATCCTTCCTCACAACAGCATCTGTGTTGATCAGGCTAAGCGCACGAGAGAGGAGTATGGCTCGTTGAGCGATCCTGATTTGGATGAGCC...

XR_009093074.1
GGTCGATGTTGACCGATGAACAATTTTATATGAATTTGAAGGGATTATGACGCGGAGAACCAAACAAGAGATATAGTTGAAGAACTCTATCGCCTCAGCCACATCAACCAAACATATGACTTTGTAAGAATATTAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAATGTGCAGTGTATATCCTTCCTCACAACAGCATCTGTGTTGATCAGGCTAAGCGCACGAGAGAGGAGTATGGCTCGTTGAGCGATCCTGATTTGGATGAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997404
ATGTGCTTGATTGCAGGCGACACGTTCCCTCTTGGCTGTACCTTTGATCCATCAGTCGTTCACTATGAGCATTTTGAGAGCAGCCCTGATTACAAGAATCCAGCTTTTAACACCAAGCTTGGAGTTTATACAGAGGGCTGTGGACTGGACAATGTTGTGATGTCGTGGGGGCACAACGACTACATGTACCTCGTGGCTAAGGAAAACAAGCACTCTTCATCATCCGATATCACCCATTTTATGCAAATATGA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778679.1
MCLIAGDTFPLGCTFDPSVVHYEHFESSPDYKNPAFNTKLGVYTEGCGLDNVVMSWGHNDYMYLVAKENKHSSSSDITHFMVSVCVWKMLRISNGFKYSS

XP_057778680.1
MCLIAGDTFPLGCTFDPSVVHYEHFESSPDYKNPAFNTKLGVYTEGCGLDNVVMSWGHNDYMYLVAKENKHSSSSDITHFMQI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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