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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002785`

染色体: Chr08 坐标: 27538318-27542077 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002785`
名称	SmilChr08G002785
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 60.1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27538318 - 27542077 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997406`
GeneID	`130997406`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997406`
原始查询	`SmilChr08G002785`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vacuolar protein sorting-associated protein 60.1-like
产物	vacuolar protein sorting-associated protein 60.1-like
Arabidopsis	`AT3G10640` (VPS60.1) SNF7 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820233] identity=84.4; qcov=1; evalue=4.43e-147; confidence=high
Rice	`Os05g0102900` - identity=79.3; qcov=1; evalue=4.9e-141; confidence=high
GO	GO:0005771 (multivesicular body); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0032511 (late endosome to vacuole transport via multivesicular body sorting pathway)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF03357 (Snf7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997406

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778682.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778682.1`
3	Vesicle	囊泡	0.80000	`XP_057778682.1`
4	Midbody	Midbody	0.80000	`XP_057778682.1`
5	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057778682.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27538694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,C1,C61
`Chr8:27539584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:27539594`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B128,B66,B74,C44
`Chr8:27540226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:27540329`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B76,B8,B97,C51,C57
`Chr8:27540355`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B118,C19
`Chr8:27540396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:27540776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B22,B23,B24,D1
`Chr8:27540784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B18,B42,B43,B90
`Chr8:27540878`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:27540888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:27540920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C80,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778682.1

237 aa

118

237

Snf7

PF03357 Snf7 12-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778682.1`	Pfam	`PF03357`	Snf7	Family	12	209	2.5e-50	171.2	Snf7

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922699.1
TGGGCCAACACAAAAAAGAATTGGCCAAAAATTCCCGAATCTGTTGGGACCCACCCAGCTTGAGCTCATCACATGCACGGCCGTCCATGGAGTTTCTCGATAAAATTCCAGTATTTACTTGGAAACTTCGTTAAACCTTCTCCAAATACGTTAACCATTAATTAATATTTCTACCTTTTACACCGTCAATCTTTCATTCCTCCTTCTCCCTCAGTTTCAACTATATTGTTATTGTTAGTTGCTAATCTCATCTATACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997406
ATGAGGAGGGTGTTCGGAGTGAAGAAGGATAAGGAACCGCCCCCATCCGTTCAAGATGCCTCTGATCGGATAAATAAAAGAGGTGAAAGTGTTGATGAAAAGATACAAAAACTCGATGCTGAATTAGCGAGATATAAGGAGCAGATTAAGAAGACGCGGCCAGGTCCAGCACAAGAAGCTGTCAAGGCTAGAGCAATGAGGGTTCTTAAGCAAAAGAAAATGTATGAAGGTCAGCGTGATATGCTATACAATCAGACATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778682.1
MRRVFGVKKDKEPPPSVQDASDRINKRGESVDEKIQKLDAELARYKEQIKKTRPGPAQEAVKARAMRVLKQKKMYEGQRDMLYNQTFNLDQVSFAAEGIKDAQQTMSALKSANKELKGMMKTVKIQDIDNLQDEMMDLMDVSNEIQESLGRSYNVPDDIDEDDLMGELDALEADMGFETEGDGVPSYLQPDKESDLDSELNLPSAPSGHAPNPASRANMQGEDELGLPTVPRATLRG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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