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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002790`

染色体: Chr08 坐标: 27597392-27604058 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002790`
名称	SmilChr08G002790
描述	uncharacterized SmilChr08G002790
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27597392 - 27604058 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997411`
GeneID	`130997411`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997411`
原始查询	`SmilChr08G002790`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0648900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os03g0648900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G38680` (AT2G38680) 5'-nucleotidase / magnesium ion binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818450] identity=60.4; qcov=0.988; evalue=2.53e-141; confidence=high
Rice	`Os03g0648900` - identity=68.6; qcov=0.839; evalue=3.68e-145; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008253 (5'-nucleotidase activity)
KEGG	smil00240 (Pyrimidine metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01232 (Nucleotide metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05822 (UMPH-1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997411

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778689.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778690.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.80000	`XP_057778689.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778690.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778690.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27601084`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:27601561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778689.1

350 aa

175

350

UMPH-1

PF05822 UMPH-1 85-339 aa

XP_057778690.1

342 aa

171

342

UMPH-1

PF05822 UMPH-1 77-331 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778689.1`	Pfam	`PF05822`	UMPH-1	Family	85	339	5.6e-89	298.6	Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1)
`XP_057778690.1`	Pfam	`PF05822`	UMPH-1	Family	77	331	5.2e-89	298.7	Pyrimidine 5'-nucleotidase (UMPH-1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922706.1
ACTTTTTTATTTTATTTTTTTTATTCATCCCAACCCTTTTACAACAGCTATCAAACACCACACCACTCTGCTTCCTCATGAGCTGTTGGCTTCGAATTTCCTTTCTCCCCATTCGCTTCGTCCCTTTCCACCTAAGGTTCAGAGGTCAGTGTGGGGTGTTGTGTAGAAACTACTGCAATAACAGAGACAATCGAGGTGAAACTATGGAGCATGTTGTGTGTGATGGTGCTCAAGTAATGGTGGGAGATCCTCAATTGCTG...

XM_057922707.1
ACTTTTTTATTTTATTTTTTTTATTCATCCCAACCCTTTTACAACAGCTATCAAACACCACACCACTCTGCTTCCTCATGAGCTGTTGGCTTCGAATTTCCTTTCTCCCCATTCGCTTCGTCCCTTTCCACCTAAGGTTCAGAAACTACTGCAATAACAGAGACAATCGAGGTGAAACTATGGAGCATGTTGTGTGTGATGGTGCTCAAGTAATGGTGGGAGATCCTCAATTGCTGCAGAGCAAAATATCATCTATTCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997411
ATGAGCTGTTGGCTTCGAATTTCCTTTCTCCCCATTCGCTTCGTCCCTTTCCACCTAAGGTTCAGAGGTCAGTGTGGGGTGTTGTGTAGAAACTACTGCAATAACAGAGACAATCGAGGTGAAACTATGGAGCATGTTGTGTGTGATGGTGCTCAAGTAATGGTGGGAGATCCTCAATTGCTGCAGAGCAAAATATCATCTATTCGACGCGATGGCCCTTTAAGATTGCAGGTTATTGCAGATTTTGACGCCACGCTAAC...

LOC130997411
ATGAGCTGTTGGCTTCGAATTTCCTTTCTCCCCATTCGCTTCGTCCCTTTCCACCTAAGGTTCAGAAACTACTGCAATAACAGAGACAATCGAGGTGAAACTATGGAGCATGTTGTGTGTGATGGTGCTCAAGTAATGGTGGGAGATCCTCAATTGCTGCAGAGCAAAATATCATCTATTCGACGCGATGGCCCTTTAAGATTGCAGGTTATTGCAGATTTTGACGCCACGCTAACTAAGTATATGGTCAATGGGCAGCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778689.1
MSCWLRISFLPIRFVPFHLRFRGQCGVLCRNYCNNRDNRGETMEHVVCDGAQVMVGDPQLLQSKISSIRRDGPLRLQVIADFDATLTKYMVNGQRGHSSHALLQQGNPEYDLKRQKLYDHYHPLEIDPTIPLDEKAKLMEEWWEKSHGLLVEGGLNFDAIRSSVVKSRIAFRDGVTELFELLERCNVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRPFKNVKIVSNRMVFDKNGNLVSFKGKTIHVLNKNEHAIDMAGPVHEELGY...

XP_057778690.1
MSCWLRISFLPIRFVPFHLRFRNYCNNRDNRGETMEHVVCDGAQVMVGDPQLLQSKISSIRRDGPLRLQVIADFDATLTKYMVNGQRGHSSHALLQQGNPEYDLKRQKLYDHYHPLEIDPTIPLDEKAKLMEEWWEKSHGLLVEGGLNFDAIRSSVVKSRIAFRDGVTELFELLERCNVPVLIFSAGLADIIEEVLRQKLHRPFKNVKIVSNRMVFDKNGNLVSFKGKTIHVLNKNEHAIDMAGPVHEELGYSEESTPDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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