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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002802`

染色体: Chr08 坐标: 27781298-27783848 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002802`
名称	SmilChr08G002802
描述	GRF1-interacting factor 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27781298 - 27783848 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997439`
GeneID	`130997439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997439`
原始查询	`SmilChr08G002802`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GRF1-interacting factor 1
产物	GRF1-interacting factor 1
Arabidopsis	`AT5G28640` (AN3) SSXT family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832968] identity=63.8; qcov=1.09; evalue=1.37e-62; confidence=high
Rice	`Os03g0733600` (OsGIF3) - identity=64.5; qcov=0.576; evalue=5.74e-41; confidence=medium
GO	GO:0003713 (transcription coactivator activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0008283 (cell population proliferation); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0048366 (leaf development)
KEGG	-
Pfam	PF05030 (SSXT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778748.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057778748.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778748.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778748.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778748.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27781477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4
`Chr8:27781590`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr8:27781593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C11
`Chr8:27781694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:27781699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr8:27781759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B134,B74,C2
`Chr8:27781790`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B19
`Chr8:27781790`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B19
`Chr8:27781792`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr8:27781798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778748.1

210 aa

105

210

SSXT

PF05030 SSXT 19-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778748.1`	Pfam	`PF05030`	SSXT	Family	19	74	1.9e-21	76.1	SSXT protein (N-terminal region)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922765.1
GTACACATATTCTTTTTTACATTAGTTTTAATCCATCATATTATTCACGTAGGTGCAAATATCCTCAGCCACTAGTACCTATGCCACTGCTCGCACTGCCCTCAGATTATATATATACACCCATACATATTTACTTACACCTTCGCTTAATCTTGTTTATTGCGCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGTTTGGGTTGGGCTCAGTTCTTGAACTCCAAGTTACAAATATAAAGAGGGTGTTTGTGAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997439
ATGCAGCAGCACCTGATGCAGATGCAGCCCATGATGGCAGCCTACTATCCCAGCAACGTCACTACTGATCACATTCAACAGTATCTTGATGAGAACAAATCGCTGATTTTGAAGATTGTGGAGAGCCAAAACTCGGGAAAGCTGAGTGAGTGTGCTGAGAACCAAGCCAGACTACAAAGAAACTTGATGTATCTCGCCGCCATTGCTGATTCACAGCCTCAGCCACCAACCATGCATTCTCAGTATCCCGGAGGCGGGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778748.1
MQQHLMQMQPMMAAYYPSNVTTDHIQQYLDENKSLILKIVESQNSGKLSECAENQARLQRNLMYLAAIADSQPQPPTMHSQYPGGGMIQPGAHYLQQHQQAQQQMTSQSLMAARSSMLYGSQPYPSLQQQALHSQLGMGSGGLMLQGEPGASSGGLGGGGFPDFVSRGGDGGMQSRGMGGKQDMGGNGGGGEGRGDGGETLYLKSSEDGN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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