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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002815`

染色体: Chr08 坐标: 27989326-27990732 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002815`
名称	SmilChr08G002815
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27989326 - 27990732 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997441`
GeneID	`130997441`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997441`
原始查询	`SmilChr08G002815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-3-like
产物	peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP19-3-like
Arabidopsis	`AT3G56070` (ROC2) rotamase cyclophilin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824773] identity=80.7; qcov=0.983; evalue=2.02e-102; confidence=high
Rice	`Os09g0571400` (OsCYP19-3) - identity=80.3; qcov=0.994; evalue=7.98e-106; confidence=high
GO	GO:0000413 (protein peptidyl-prolyl isomerization); GO:0003755 (peptidyl-prolyl cis-trans isomerase activity); GO:0006457 (protein folding)
KEGG	-
Pfam	PF00160 (Pro_isomerase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997441

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778750.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778750.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057778750.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778750.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778750.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27990264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B77,C19,D6
`Chr8:27990278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:27990285`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C13
`Chr8:27990285`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C13
`Chr8:27990320`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B103
`Chr8:27990320`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B103
`Chr8:27990363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,B19,B53,B60,B88
`Chr8:27990366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C50,D11
`Chr8:27990379`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C82
`Chr8:27990379`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C82
`Chr8:27990393`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	2	B104,C50
`Chr8:27990393`	`C`	`CTA`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B104,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778750.1

174 aa

174

Pro_isomerase

PF00160 Pro_isomerase 14-169 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778750.1`	Pfam	`PF00160`	Pro_isomerase	Domain	14	169	3.2e-49	168.0	Cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase/CLD

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922767.1
ATTTAATTTTGAAATAATCAAGGGGCGATGTGAGAATATGCGAAAGCATAAGGCCAAACTCGGAAAAGAAGAAACTCTTAAACCCTAAAACCCAAGCTCATCTCGCAGCCACTGCAGTCGCCTCCTGTTATATATTCATATCACAGTGAGTCTTCACTTAGCATCGTCTTCCTCTCTCAAACTTCACTCAGAATGAAGAACCCTAAGGTTTTCTTCGACATATTGATCGGGAGAGCGAAAGCTGGGCGCGTAGTGATGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997441
ATGAAGAACCCTAAGGTTTTCTTCGACATATTGATCGGGAGAGCGAAAGCTGGGCGCGTAGTGATGGAGCTCTTCGCGGATACCACTCCGAAAACCGCCGAGAATTTCCGAGCTCTGTGCACCGGCGAGAAAGGGATCGGATCTAGCGGGAAACCGCTGCATTTCAAAGGATCTGCTTTCCATCGCATTATCCCCAATTTCATGTGTCAAGGCGGTGACTTCACTCGCGGCAACGGGACCGGTGGAGAATCCATTTATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778750.1
MKNPKVFFDILIGRAKAGRVVMELFADTTPKTAENFRALCTGEKGIGSSGKPLHFKGSAFHRIIPNFMCQGGDFTRGNGTGGESIYGAKFADENFTLKHTKPGLLSMANSGKNTNGSQFFITTATTSWLDGKHVVFGEVVDGYSVVKEMEKVGSEAGPPSAKVLIEDCGQILED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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