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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002828`

染色体: Chr08 坐标: 28131007-28136192 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002828`
名称	SmilChr08G002828
描述	protein CHLOROPLAST J-LIKE DOMAIN 1, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28131007 - 28136192 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997435`
GeneID	`130997435`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997435`
原始查询	`SmilChr08G002828`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CHLOROPLAST J-LIKE DOMAIN 1, chloroplastic
产物	protein CHLOROPLAST J-LIKE DOMAIN 1%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT1G08640` (CJD1) Chloroplast J-like domain 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837386] identity=64.7; qcov=0.908; evalue=3.84e-120; confidence=high
Rice	`Os08g0127600` - identity=55.6; qcov=0.792; evalue=1.11e-92; confidence=high
GO	GO:0031969 (chloroplast membrane)
KEGG	-
Pfam	PF11833 (CPP1-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997435

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778742.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057778742.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778742.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778742.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778742.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28131129`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B26,B41,B73,C77
`Chr8:28131152`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B90,B92,C31,C73
`Chr8:28131298`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C15,C87
`Chr8:28131317`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B37,B42,B43,B97
`Chr8:28131356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:28134288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B50,C29
`Chr8:28134335`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	90	A1,A14,A16,A18,A4,A5,B100,B102,B107,B108,B11,B112,B114,B115,B119,B120,B122,B123,B124,B126,B133,B134,B136,B137,B138,B14,B17,B19,B23,B27,B36,B38,B39,B46,B5,B50,B54,B55,B57,B60,B64,B65,B67,B68,B69,B74,B77,B78,B81,B83,B87,B90,B92,B93,B94,B95,B98,C11,C13,C15,C16,C17,C19,C2,C26,C27,C31,C33,C38,C39,C41,C43,C47,C48,C5,C6,C60,C65,C69,C70,C72,C73,C74,C80,C84,D1,D3,D7,D8,D9
`Chr8:28134387`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B120,B8,C30,C68
`Chr8:28134387`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B120,B8,C30,C68
`Chr8:28134431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	B11,B37,B42,B43,B97
`Chr8:28134431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B37,B42,B43,B97
`Chr8:28134497`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B37,B42,B43,B97

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778742.1

339 aa

170

339

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 86-186 aa

XP_057778743.1

284 aa

142

284

CPP1-like

PF11833 CPP1-like 86-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778742.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	86	186	1.7e-12	48.1	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like
`XP_057778743.1`	Pfam	`PF11833`	CPP1-like	Family	86	186	5.6e-12	46.4	Protein CHAPERONE-LIKE PROTEIN OF POR1-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922760.1
CCAAAACCCACCCACAAAAACCCTAACCAGATATCTCCTGATCCATTGATTGCTGTTGTCCGCTTGAATCAATGGCCTTGTCGATAATCCACTGCCCCCAAACCCCTAAATTTCTGCCCAATGGTCGTTTTCTCAAATCCCGTGCGCTTCCGCTTCGCCCTACATTTCTTAGGTTTTCCACATTTCAGCCACGTAGCAGCAGAAGATTTATTTGCGCGGCATTTTCTGCCGCCGGAAGTTCTGGTTCAAACAGCGATGTG...

XM_057922759.1
AAACCCACCCACAAAAACCCTAACCAGATATCTCCTGATCCATTGATTGCTGTTGTCCGCTTGAATCAATGGCCTTGTCGATAATCCACTGCCCCCAAACCCCTAAATTTCTGCCCAATGGTCGTTTTCTCAAATCCCGTGCGCTTCCGCTTCGCCCTACATTTCTTAGGTTTTCCACATTTCAGCCACGTAGCAGCAGAAGATTTATTTGCGCGGCATTTTCTGCCGCCGGAAGTTCTGGTTCAAACAGCGATGTGAAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997435
ATGGCCTTGTCGATAATCCACTGCCCCCAAACCCCTAAATTTCTGCCCAATGGTCGTTTTCTCAAATCCCGTGCGCTTCCGCTTCGCCCTACATTTCTTAGGTTTTCCACATTTCAGCCACGTAGCAGCAGAAGATTTATTTGCGCGGCATTTTCTGCCGCCGGAAGTTCTGGTTCAAACAGCGATGTGAACCCATATGAGGTTCTTGGTGTAAACCCTCTTGAGGGATTTGACATGGTCAAGGCAGCTTACTCGAAAAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778742.1
MALSIIHCPQTPKFLPNGRFLKSRALPLRPTFLRFSTFQPRSSRRFICAAFSAAGSSGSNSDVNPYEVLGVNPLEGFDMVKAAYSKKRKDAEKRGDEAAAAQLEKAYDKIMMSQLKKRKHGETFGSFKVSKDIKYADKLPVVPWGPRFTKSETKDIQINMAISALFTAWIFIMRNAEYKPLQFLAFVFVYRIFEKLKASEPSASPTFSEEGEDEGRMLRMGKRLLRSLSLVFGCLAFASLVSGMIQVLIMYYVVFKWVAE...

XP_057778743.1
MALSIIHCPQTPKFLPNGRFLKSRALPLRPTFLRFSTFQPRSSRRFICAAFSAAGSSGSNSDVNPYEVLGVNPLEGFDMVKAAYSKKRKDAEKRGDEAAAAQLEKAYDKIMMSQLKKRKHGETFGSFKVSKDIKYADKLPVVPWGPRFTKSETKDIQINMAISALFTAWIFIMRNAEYKPLQFLAFVFVYRIFEKLKASEPSASPTFSEEGEDEGRMLRMGKRLLRSLSLVFGCLAFASLGYTGVLNVIEYAAGFVPVFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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