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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002832`

染色体: Chr08 坐标: 28194482-28206040 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002832`
名称	SmilChr08G002832
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28194482 - 28206040 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997426`
GeneID	`130997426`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997426`
原始查询	`SmilChr08G002832`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like
产物	serine/threonine protein phosphatase 2A regulatory subunit B''beta-like
Arabidopsis	`AT5G28850` (AT5G28850) Calcium-binding EF-hand family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833004] identity=78.6; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os10g0476600` (OsPP2A-B'') - identity=77.2; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000159 (protein phosphatase type 2A complex); GO:0005509 (calcium ion binding); GO:0006470 (protein dephosphorylation); GO:0019888 (protein phosphatase regulator activity)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil04382 (Cornified envelope formation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF13499 (EF-hand_7); PF13833 (EF-hand_8); PF17958 (EF-hand_13)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997426

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778724.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778724.1`
3	Cell projection	细胞突起	0.40000	`XP_057778724.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778724.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778724.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28196193`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B11,B81,B95
`Chr8:28198294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:28198322`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B61
`Chr8:28204069`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:28204238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778724.1

538 aa

269

538

EF-hand_13

EF-hand_7

EF-hand_8

PF17958 EF-hand_13 215-304 aa PF13499 EF-hand_7 320-419 aa PF13833 EF-hand_8 399-421 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778724.1`	Pfam	`PF17958`	EF-hand_13	Domain	215	304	5e-33	113.4	EF-hand domain
`XP_057778724.1`	Pfam	`PF13499`	EF-hand_7	Domain	320	419	1.4e-16	61.3	EF-hand domain pair
`XP_057778724.1`	Pfam	`PF13833`	EF-hand_8	Domain	399	421	2.8e-09	37.3	EF-hand domain pair

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922741.1
AATAATCTTATTATTGTTAGTATAATTGTCATCACTACTACTCCTTCCTTTTCTCGCTCGCTCTCTCTCTCTCTATCTCTCTTCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGCTCGTGCGCATACACCTCTTTTTTGCTCCAAGGGTTTGTAATTCCAGCACCGATTCCGTCCCTCCGATCTCAGTTTCGTCCGTATTCTAGGGTTTGTACGCTGCCTACATCTGGAAATATTCTCACGATTTACAGATTCTGAATCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997426
ATGGATTTGGATTTCAATGGCGACATCGCGAGCCTCGATGCCGAGCTCTTGCAGCTCGGGGAGGTGTCTCCTTTGGCTATCAAGGCCAATCCTTGTGTTGCCGTGAAGCTTTTCGATCAGTGGCTATCTATCCCAGAAACCAATTCTTTGGTAAAATCCTTGCTTAATAATGCTAAAGGAGTAGGTCCTGTGAATGCCGCTGGAACATCCTCTGGCTCAAATGCTGCAGCTAGCAATACATTGCCCTCAATGTTTCCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778724.1
MDLDFNGDIASLDAELLQLGEVSPLAIKANPCVAVKLFDQWLSIPETNSLVKSLLNNAKGVGPVNAAGTSSGSNAAASNTLPSMFPAGSTPPLSPRSSSGSPRLTKQRGPSVLGSPLKLVNEPVKEHIPQFYFLNGRPPPNELKERCLFRINQFFYGHVDGLQMHEFKPVTKEICKLPSFFSAALFRKIDADCSGIVTRDAFVDYWINGNMLTKDLATQIYTILKQPDVRCLAQDDFKPVLRELLTTHPGLEFLQSTPEF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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