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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002866`

染色体: Chr08 坐标: 28497330-28500088 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002866`
名称	SmilChr08G002866
描述	probable protein phosphatase 2C 34
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28497330 - 28500088 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997477`
GeneID	`130997477`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997477`
原始查询	`SmilChr08G002866`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 34
产物	probable protein phosphatase 2C 34
Arabidopsis	`AT5G27930` (AT5G27930) Protein phosphatase 2C family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832860] identity=70.3; qcov=0.917; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0358500` (OsPP2C48) - identity=58.9; qcov=0.946; evalue=1.36e-144; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997477

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778774.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778774.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778774.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778774.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778774.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28497598`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B108,C85
`Chr8:28497598`	`GTA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B108,C85
`Chr8:28497601`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B108,C85
`Chr8:28497601`	`C`	`CGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B108,C85
`Chr8:28497729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C85
`Chr8:28499062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:28499231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778774.1

386 aa

193

386

PP2C

PF00481 PP2C 158-348 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778774.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	158	348	6.8e-41	141.3	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922791.1
CTTGTAGCACTAGTTCTACATATGTGTGCGTCTTTGTTTTCTTCTCCTCTCTCTCCCTTCACAATTCACATTCAAATAAGCCATGGATGTCCATCCTTCCTCACTCTCTCCATTTCTCACCTTCTTTTCCGGCAACCCACCTCATCTTCCCGCCCACTTATTCTTCTCTGAAGATTCAAGGTGTTTAATTTGTGTCTCATTTCAATGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTCGGTTGGCTGTTAGCCTGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997477
ATGATGTTGGAATTCCATGTTGTGAGCAGAAGTATCTGTGGAGGGGATATGGGGCATTTTTCTTCGATGTTCAATGGGCTGGCGAGGTCGATTTCTTCAATCAAGAAAACGAGAAATTTGAAGAACAATGATGATGGGAAAGAGGCTGTTAAAGCTATGGCGAAGGATGCCAAGAAAAATGAGTTGATATTGAGGTCATCAGGAATCGTGAATGTAGATGGCTCCAACAACTTGGCCTCAGTTTACTCAAAGAGGGGAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778774.1
MMLEFHVVSRSICGGDMGHFSSMFNGLARSISSIKKTRNLKNNDDGKEAVKAMAKDAKKNELILRSSGIVNVDGSNNLASVYSKRGEKGVNQDCCIVWEEFGCQEDMIFCGIFDGHGPWGHFVAKNVRDSMPSSLLCNWQETLVDAAVDPDFDLGSQKKLHSFNIWKHSYLKTCAAVDQQLEHHRKIDAFNSGTTALTIVRQGENMFLANVGDSRAVLGTPSDDGDMVAVQLSTDFKPNLPQEAERITECNGRVYSLDDE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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