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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002872`

染色体: Chr08 坐标: 28593885-28595342 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002872`
名称	SmilChr08G002872
描述	uncharacterized SmilChr08G002872
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28593885 - 28595342 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998282`
GeneID	`130998282`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998282`
原始查询	`SmilChr08G002872`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G31430` (AT3G31430) zinc knuckle (CCHC-type) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822909] identity=26.4; qcov=0.328; evalue=3.55e-09; confidence=low
Rice	`Os12g0156200` - identity=29.5; qcov=0.447; evalue=3.27e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14111 (DUF4283); PF14392 (zf-CCHC_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998282

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779697.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779697.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779697.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779697.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779697.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28593892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:28593933`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B47,B99
`Chr8:28593941`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B43,C4,C55,C83
`Chr8:28593955`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr8:28593978`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A9
`Chr8:28594011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr8:28594116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr8:28594136`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D8
`Chr8:28594143`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,D8
`Chr8:28594176`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B40,D8
`Chr8:28594176`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B40,D8
`Chr8:28594181`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B115

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779697.1

485 aa

242

485

DUF4283

zf-CCHC_4

PF14111 DUF4283 42-119 aa PF14392 zf-CCHC_4 176-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779697.1`	Pfam	`PF14111`	DUF4283	Domain	42	119	1.9e-13	50.6	Domain of unknown function (DUF4283)
`XP_057779697.1`	Pfam	`PF14392`	zf-CCHC_4	Domain	176	223	6.6e-08	32.8	Zinc knuckle

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923714.1
ATGGAGCGCGGAGGTCCGTCCAGTGATTCAGATTTGGTGAACGGCCCGGAAGAACGCACTGATCGTGAAGCGACTTTGATTGACATCTCTTCGGATTTTGATAATCAATCGGACAAGGGGATCTGTCTGGTGGGAAGTCTGATTTCTATGAAAGCCCCTAATGGATTCCATCTAATGGAAATTATGAGGAAGTCGTGGAAAACAGAGCAGAACTTTGAAGCCAGGGAATGGCGGAAAAATCTTTTCCTCTTCACCTTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998282
ATGGAGCGCGGAGGTCCGTCCAGTGATTCAGATTTGGTGAACGGCCCGGAAGAACGCACTGATCGTGAAGCGACTTTGATTGACATCTCTTCGGATTTTGATAATCAATCGGACAAGGGGATCTGTCTGGTGGGAAGTCTGATTTCTATGAAAGCCCCTAATGGATTCCATCTAATGGAAATTATGAGGAAGTCGTGGAAAACAGAGCAGAACTTTGAAGCCAGGGAATGGCGGAAAAATCTTTTCCTCTTCACCTTTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779697.1
MERGGPSSDSDLVNGPEERTDREATLIDISSDFDNQSDKGICLVGSLISMKAPNGFHLMEIMRKSWKTEQNFEAREWRKNLFLFTFESAADREWVLQRQPWHFDNHLFAIKGLDDTAQPSTIRVDRGSFWIRAYNLPIKCMTPAIIRNIGKQIGIVEEVDEKTNYTGCFARFKVNLDITVPLLRGITIFFEARQLWIPLKYESLPIYCYKCGIMNHHTRACEKETEAEESGKHFDDIEYGPILKASPLKRLRTKKQHQPM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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