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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；身份待核实的名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002874`

染色体: Chr08 坐标: 28649072-28652752 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G002874`
名称	SmilChr08G002874
描述	calmodulin-binding protein 60 B-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28649072 - 28652752 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997482`
GeneID	`130997482`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997482`
原始查询	`SmilChr08G002874`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	calmodulin-binding protein 60 B-like
产物	calmodulin-binding protein 60 B-like
拟南芥	`AT2G18750` (AT2G18750) Calmodulin-binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816390] identity=33.77; qcov=0.989; evalue=7.66e-93; confidence=low
水稻	`Os02g0177800` - identity=47.62; qcov=0.598; evalue=2.94e-93; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005516 (calmodulin binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:0080142 (regulation of salicylic acid biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF07887 (Calmodulin_bind); PF20451 (Calmod_bind_M); PF20452 (Calmod_bind_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997482

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`XP_057778793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28650890`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:28650944`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B115,B98,C80
`Chr8:28651048`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C83
`Chr8:28651394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,D6
`Chr8:28651620`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B132,B15,C15
`Chr8:28651700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:28652024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:28652420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B60,B76,C32,C68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778793.1

542 aa

271

542

Calmodulin_bind

Calmod_bind_M

Calmod_bind_C

PF07887 Calmodulin_bind 81-227 aa PF20451 Calmod_bind_M 240-303 aa PF20452 Calmod_bind_C 312-363 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`XP_057778793.1`	Pfam	`PF07887`	Calmodulin_bind	Domain	81	227	3.4e-51	173.9	Calmodulin binding protein-like N-terminal domain
`XP_057778793.1`	Pfam	`PF20451`	Calmod_bind_M	Domain	240	303	1.2e-27	96.9	Calmodulin binding protein central domain
`XP_057778793.1`	Pfam	`PF20452`	Calmod_bind_C	Domain	312	363	2.7e-14	53.8	Calmodulin binding protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922810.1
ACGTGGAGTAACTAACTGGAGTCGATCTCGTAGTAGCAACAGAACCGGAAACGGATCCACCGAACCGGATTTTAGAGTGATGAAACCGGAAACCGGTCCGCGACGACTTCTCAAGTCCACGCGAGCGGATTATTGTATAGTCAGCACATCCGTGTTTTTTTCACCCCCCCCCCCTCTCAAGCTCTACCACTCTACACCTTTTTTAATAATTGGAGTGTCGCTGCATTCAGGAATAATATATCTTGTTGATTTGTACTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778793.1_44032
ATGGTTCAGAAACGGCAGCACAGGCAGCAGGGTGACGAGGAAGGTTCTCGACTTCCAAATAAACGCCGGCATTTCGCATCCACTTTGTTGAAAGGGCTGAATCATGGCAGGACTTCTGAAGAACATATATCCTGTTTGGAACCTATCCTCAGAAAAATGGTTCAAGAGTCAGTGGAGCATGCATTTAACCAGTTTATGAGATCCTCTTACAATCAAGTGGAATGTCCTGCAACAAGGATTTTGCAGCTGCAGTTTCATAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778793.1
MVQKRQHRQQGDEEGSRLPNKRRHFASTLLKGLNHGRTSEEHISCLEPILRKMVQESVEHAFNQFMRSSYNQVECPATRILQLQFHSNLPETLFTGNRLLSEDRSPIKVVLYDSASRQIMSWSTLSSMKVTVVVLDGDFVPDDKEDWMKQEFENKQVKNREGKRPLVAGEVTVTLKDGVGYIGELSFTDNSKWSRTGKFRLGVKAQPTPDNISIREAVSNAFRVKDHRGESYQKHYPPALGDEVWRLDKIAKDGISHKKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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