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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002875`

染色体: Chr08 坐标: 28661394-28663210 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002875`
名称	SmilChr08G002875
描述	uncharacterized SmilChr08G002875
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28661394 - 28663210 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997483`
GeneID	`130997483`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997483`
原始查询	`SmilChr08G002875`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842083]; symbol=AT1G56300; hit=AT1G56300; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842083]; symbol=AT1G56300; hit=AT1G56300; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G56300` (AT1G56300) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842083] identity=62.9; qcov=0.785; evalue=1.88e-47; confidence=medium
Rice	`Os03g0300600` (OsDjC28) - identity=56.6; qcov=0.715; evalue=2.86e-35; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997483

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778794.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778794.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057778795.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057778794.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778794.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28661896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:28662738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:28662908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:28662988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:28663009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B98,C13,C50,C7,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778794.1

159 aa

159

DnaJ

PF00226 DnaJ 14-79 aa

XP_057778795.1

158 aa

158

DnaJ

PF00226 DnaJ 14-79 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778794.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	14	79	9e-25	87.3	DnaJ domain
`XP_057778795.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	14	79	9.3e-25	87.2	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922811.1
ACCCAATTCGTTTAGCTTGCAGAAAATATCTTCCATTCTGGAAGCTTCGGTCTTCCTCGTAGATATTTTACATCCCCCGTTGTACCACGCCTCGCTCGCATCCTTATCACCCCTTTATAATGAAATAGGCTTCGCTTCGTCGTTTTCCGCTATTTCGGTACATGCTCAATCGAAGCACAATTCTCTGCCATCACTAAATGCTCCCCCTTTAATCTTCCCTGGAAGATTAAATTAATCGGAAAGTCGAAGCTAATCAGGTC...

XM_057922812.1
ATATCTTCCATTCTGGAAGCTTCGGTCTTCCTCGTAGATATTTTACATCCCCCGTTGTACCACGCCTCGCTCGCATCCTTATCACCCCTTTATAATGAAATAGGCTTCGCTTCGTCGTTTTCCGCTATTTCGGTACATGCTCAATCGAAGCACAATTCTCTGCCATCACTAAATGCTCCCCCTTTAATCTTCCCTGGAAGATTAAATTAATCGGAAAGTCGAAGCTAATCAGGTCGCGGTATGGATCGGGAAGGAGGATC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997483
ATGGATCGGGAAGGAGGATCCGCAGTCGGGTCTTATTGCTACTACACCGTTCTCGGCATTCGCAAGGACGCCTCCTTCTCCGACATCCGCTCCGCCTACCGCAAGCTGGCGCTCAAATGGCATCCCGACAGGTGGGCGAAGAATCCGTCCGCCGCTGGAGAAGCAAAGCGCCGCTTCCAGAAAATACAAGAAGCCTACGCTGTATTGTCTGATAAGGGGAAGAGGTCAATGTACGATGCGGGATTCCTCGATCTGCTTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778794.1
MDREGGSAVGSYCYYTVLGIRKDASFSDIRSAYRKLALKWHPDRWAKNPSAAGEAKRRFQKIQEAYAVLSDKGKRSMYDAGFLDLLEEDEGMGDFLHDLMKMMEQNVGDEKEESLEDLQKTFVDLFGDDLADMIKESGDPTVRMMGCNTRGVPKRSARV

XP_057778795.1
MDREGGSAVGSYCYYTVLGIRKDASFSDIRSAYRKLALKWHPDRWAKNPSAAGEAKRRFQKIQEAYAVLSDKGKRSMYDAGFLDLLEEDEGMGDFLHDLMKMMEQNVGDEEESLEDLQKTFVDLFGDDLADMIKESGDPTVRMMGCNTRGVPKRSARV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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