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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002881`

染色体: Chr08 坐标: 28706808-28711706 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002881`
名称	SmilChr08G002881
描述	uncharacterized SmilChr08G002881
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28706808 - 28711706 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997490`
GeneID	`130997490`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997490`
原始查询	`SmilChr08G002881`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819745]; symbol=AT3G05760; hit=AT3G05760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819745]; symbol=AT3G05760; hit=AT3G05760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05760` (AT3G05760) C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819745] identity=80.4; qcov=0.985; evalue=5.37e-97; confidence=high
Rice	`Os03g0831900` (OSJNBb0027B08.2) - identity=81.2; qcov=0.975; evalue=5e-95; confidence=high
GO	GO:0000398 (mRNA splicing, via spliceosome); GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005681 (spliceosomal complex); GO:0008270 (zinc ion binding); GO:0046540 (U4/U6 x U5 tri-snRNP complex)
KEGG	smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF12171 (zf-C2H2_jaz); PF12874 (zf-met)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997490

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778801.1`
2	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057778801.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778801.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778801.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778801.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28707718`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,C60
`Chr8:28707750`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:28708429`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B110,B41,C70,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778801.1

202 aa

101

202

zf-met

zf-C2H2_jaz

PF12874 zf-met 84-108 aa PF12171 zf-C2H2_jaz 84-109 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778801.1`	Pfam	`PF12874`	zf-met	Domain	84	108	7.7e-07	29.9	Zinc-finger of C2H2 type
`XP_057778801.1`	Pfam	`PF12171`	zf-C2H2_jaz	Family	84	109	3e-06	28.0	Zinc-finger double-stranded RNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922818.1
TTTTTTTATAATAAAATGAAAAAGTCACAAAAATCTTTTCTAATTTAATCTATATAAAAAATTGATCAACTTAATTGAAATAGTTCAAAATAAATATTGATCAAATTAATTGGGAATTTTTTGTAGAAAAGAGAAAGTAGTAAATATTACTTTTATCAACGCCAATTATGTTAATTTTGATAATTATGAATATATGAATATAGTTTCTACAAACTCGTTTTTTTAAGATTATATCTACTAACTCGAGTAAAAAAAAGATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997490
ATGGCTCAATCTGGCAACGGCGCTGCTGGAATTGATAACACTTTTCGAAAAAAATTCGACCGAGAGGAGTATCTGCAACGCGCTCGGGACCGCGAAGCTAAGGAAGAAGCTCGGAACAAATCAAAATCAAGTGGTCCACCGGTGCAAAGGAAACCATTGAAGCACAGAGATTATGAAGTGGACCTCGAATCACGCTTGGGGAAGACTCAGGTTGTGACTCCTATTGCGCCCCTCAGTCAACAGGCTGGATACTACTGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778801.1
MAQSGNGAAGIDNTFRKKFDREEYLQRARDREAKEEARNKSKSSGPPVQRKPLKHRDYEVDLESRLGKTQVVTPIAPLSQQAGYYCSVCECVVKDSANYLDHINGKKHQRALGMSMRSERATLEQVQQRFEVLKKRKDTPGFTEQDFDERILKQQQEEEERKRQRREKKKEKKKEKAVEEEPEIDPDVAAMMGFGGFGSSKK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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