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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002883`

染色体: Chr08 坐标: 28716000-28716542 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002883`
名称	SmilChr08G002883
描述	protein DMP4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28716000 - 28716542 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998285`
GeneID	`130998285`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998285`
原始查询	`SmilChr08G002883`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DMP4-like
产物	protein DMP4-like
Arabidopsis	`AT4G18425` (AT4G18425) transmembrane protein, putative (DUF679) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827573] identity=44.8; qcov=0.956; evalue=1.22e-45; confidence=medium
Rice	`Os01g0388700` - identity=53.7; qcov=0.972; evalue=1.94e-55; confidence=high
GO	GO:0010256 (endomembrane system organization)
KEGG	-
Pfam	PF05078 (DUF679)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998285

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057779699.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057779699.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.80000	`XP_057779699.1`
4	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057779699.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779699.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28716137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B140,C22,C4,C40
`Chr8:28716182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,B16,B53,C23
`Chr8:28716519`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B55
`Chr8:28716519`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779699.1

180 aa

180

DUF679

PF05078 DUF679 17-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779699.1`	Pfam	`PF05078`	DUF679	Family	17	176	6.4e-60	202.5	Protein of unknown function (DUF679)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923716.1
ATGAAACCCAGCTCCTCAACGAGCCGGCCCGTGCAGAAAACCCTAGCGAGCGCGGCCAATCTGGCGAACCTCCTCCCAAGCGGCACGGTGTTGGCGTTTCAAACCCTGGCGCCGTCCTTCTCCAACAAGGGCGTGTGCCATTTATCAAACAGATATCTGACGGCGTGGCTCATCGGCGCATGCTCCGTCGTCTGCTTTCTGTCCTCCTTCACCGACAGCTTCACGGATTCGGAGGGCAGGCTGCACTACGGGGTGGCCAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998285
ATGAAACCCAGCTCCTCAACGAGCCGGCCCGTGCAGAAAACCCTAGCGAGCGCGGCCAATCTGGCGAACCTCCTCCCAAGCGGCACGGTGTTGGCGTTTCAAACCCTGGCGCCGTCCTTCTCCAACAAGGGCGTGTGCCATTTATCAAACAGATATCTGACGGCGTGGCTCATCGGCGCATGCTCCGTCGTCTGCTTTCTGTCCTCCTTCACCGACAGCTTCACGGATTCGGAGGGCAGGCTGCACTACGGGGTGGCCAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779699.1
MKPSSSTSRPVQKTLASAANLANLLPSGTVLAFQTLAPSFSNKGVCHLSNRYLTAWLIGACSVVCFLSSFTDSFTDSEGRLHYGVATWKGMMILNGDDDDDDEMDLSRFRVRLIDLFHAWAALAVFMAFALCDANVQGCFFPWAAPELVVNLPLAAGVFSTFFFTIFPTTRRGIGYSCQR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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