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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002889`

染色体: Chr08 坐标: 28765243-28766085 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002889`
名称	SmilChr08G002889
描述	uncharacterized SmilChr08G002889
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28765243 - 28766085 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998287`
GeneID	`130998287`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998287`
原始查询	`SmilChr08G002889`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01107 (MP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998287

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779702.1`
2	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.60000	`XP_057779702.1`
3	Autophagic vesicle	Autophagic vesicle	0.40000	`XP_057779702.1`
4	Autophagosome	Autophagosome	0.40000	`XP_057779702.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779702.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28765254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B42,C47,D7
`Chr8:28765259`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B61,C84
`Chr8:28765266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B132
`Chr8:28765294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	D2,D6
`Chr8:28765294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D2,D6
`Chr8:28765311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:28765312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,C18,C37,D5
`Chr8:28765339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B111,B50,B73,C29
`Chr8:28765339`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B50,B73,C29
`Chr8:28765347`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr8:28765437`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B104,B140,C22,C4,C40
`Chr8:28765448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D2,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779702.1

280 aa

140

280

PF01107 MP 68-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779702.1`	Pfam	`PF01107`	MP	Family	68	228	1e-25	91.2	Viral movement protein (MP)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923719.1
ATGGATCCTCCGGAGACGAGTCAGACTGAGAATGAAGAAGTTATCCACATCCAACGTGAAGATCATGAGGAATATTCCAGCCATTCCCTGATCCCACAACAGAAGATGGTGGATAAAATGAAGAACAAAAACCTGAGTATACAATTATACCAGGGATTCTCAAGAGGAAGAATAGATCAAGCTATGCAAAGTTTGATACCATTCAGAAGGAAGCATCATGTACATTTTGGTATTACAAGCCGGGAGATATCGCTTCCAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998287
ATGGATCCTCCGGAGACGAGTCAGACTGAGAATGAAGAAGTTATCCACATCCAACGTGAAGATCATGAGGAATATTCCAGCCATTCCCTGATCCCACAACAGAAGATGGTGGATAAAATGAAGAACAAAAACCTGAGTATACAATTATACCAGGGATTCTCAAGAGGAAGAATAGATCAAGCTATGCAAAGTTTGATACCATTCAGAAGGAAGCATCATGTACATTTTGGTATTACAAGCCGGGAGATATCGCTTCCAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779702.1
MDPPETSQTENEEVIHIQREDHEEYSSHSLIPQQKMVDKMKNKNLSIQLYQGFSRGRIDQAMQSLIPFRRKHHVHFGITSREISLPIELTGNQVEIQLVTAKDVRGDLAKMKPSVATTMKWIHIGAIQLVIKSALSKGIDLPIDIAICDKRITNPRDAILGAFSGNLYVKQIITELYPQIAYNIQDTNFSRALTLYQDYKRKELLKGANRPYSITCQVSYSLSNSHHTDLFMGKEFIEIPEIFKEVAKAISPERVEIPGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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