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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002892`

染色体: Chr08 坐标: 28793488-28796653 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002892`
名称	SmilChr08G002892
描述	uncharacterized SmilChr08G002892
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28793488 - 28796653 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997496`
GeneID	`130997496`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997496`
原始查询	`SmilChr08G002892`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944]; symbol=ASG1; hit=AT2G24100; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944]; symbol=ASG1; hit=AT2G24100; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G24100` (ASG1) ATP-dependent DNA helicase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816944] identity=44.6; qcov=0.494; evalue=9.54e-54; confidence=medium
Rice	`Os09g0128400` - identity=52.7; qcov=0.348; evalue=9.09e-46; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF24818 (PH_TRF2_HOY1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997496

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778806.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778806.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778806.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778806.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28793780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	93	A1,A14,A2,A20,A22,A5,A6,A7,A8,B100,B101,B103,B104,B106,B108,B111,B113,B117,B119,B120,B121,B123,B124,B127,B129,B130,B132,B134,B139,B140,B21,B22,B23,B24,B25,B29,B3,B30,B31,B33,B35,B40,B44,B50,B54,B55,B58,B59,B62,B63,B64,B67,B71,B73,B78,B79,B80,B82,B86,B88,B9,B98,C10,C11,C15,C19,C25,C27,C3,C31,C32,C36,C37,C39,C4,C43,C44,C47,C51,C52,C53,C57,C58,C63,C65,C66,C67,C69,C71,C76,C78,C82,D5
`Chr8:28793790`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	71	A1,A20,A22,A6,A7,A8,B100,B101,B103,B104,B108,B111,B113,B117,B119,B120,B121,B123,B124,B127,B129,B130,B132,B134,B139,B22,B23,B24,B25,B29,B33,B35,B40,B44,B50,B54,B55,B59,B63,B64,B67,B71,B73,B78,B79,B80,B82,B86,B88,B98,C11,C15,C19,C25,C27,C3,C31,C36,C37,C39,C4,C43,C44,C47,C52,C58,C65,C66,C71,C76,C82
`Chr8:28793798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	46	A20,A22,A6,A8,B100,B103,B104,B108,B113,B120,B121,B124,B127,B132,B134,B22,B23,B25,B29,B33,B40,B44,B50,B54,B55,B64,B71,B73,B78,B79,B80,B98,C15,C3,C31,C4,C43,C44,C47,C52,C58,C65,C71,C76,C78,C82
`Chr8:28793849`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	40	A20,A6,A8,B113,B123,B124,B127,B129,B130,B139,B24,B30,B35,B37,B40,B50,B54,B55,B59,B62,B63,B67,B80,B86,B88,C11,C15,C19,C25,C26,C3,C37,C39,C4,C43,C51,C66,C78,C80,C83
`Chr8:28793851`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	36	A20,A6,A8,B113,B123,B124,B127,B129,B130,B139,B24,B30,B35,B37,B50,B55,B59,B62,B63,B67,B80,B86,B88,C11,C15,C19,C25,C26,C3,C37,C39,C4,C43,C66,C80,C83
`Chr8:28793867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B104,B40,B64,B71,C51,C73,C78
`Chr8:28793895`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A20,A6,A8,B113,B123,B124,B127,B129,B139,B24,B30,B37,B40,B50,B54,B55,B59,B62,B63,B67,B80,B86,B88,C11,C15,C19,C25,C26,C37,C39,C4,C51,C66,C67,C73,C78,C80,C83
`Chr8:28793898`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	43	A20,A22,A6,A8,B104,B113,B123,B124,B127,B129,B139,B24,B30,B37,B40,B50,B54,B55,B59,B62,B63,B64,B67,B71,B80,B86,B88,C11,C15,C19,C25,C26,C37,C39,C4,C47,C51,C66,C67,C73,C78,C80,C83
`Chr8:28793899`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	42	A20,A6,A8,B104,B113,B123,B124,B127,B129,B139,B24,B30,B37,B40,B50,B54,B55,B59,B62,B63,B64,B67,B71,B80,B86,B88,C11,C15,C19,C25,C26,C37,C39,C4,C47,C51,C66,C67,C73,C78,C80,C83
`Chr8:28793964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:28793985`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B12,B123,B40,B59,C12
`Chr8:28793985`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B12,B123,B40,B59,C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778806.1

431 aa

216

431

PH_TRF2_HOY1

PF24818 PH_TRF2_HOY1 54-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778806.1`	Pfam	`PF24818`	PH_TRF2_HOY1	Domain	54	171	7.5e-47	158.8	TRF2/HOY1 PH-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922823.1
TCTACTAAAATTCTCCTGCGTTTTTATCTCCTGGCGCCAATCTACGTACAACCCAACACCCTGCATGCTTTGCCTCATAATCAATACTATTTGCCTTGTAAACCGCGAGTTGAAGCATGGCTGGTAATTCGCAGGGCTCTCGACGCTTCACTCTGCAGGAAATTAATTCGATGCCTCTTCTGGGATTGAAACTCCAAAAATCGGAGTCGTTGTTTAGTTTGTTGGAATCAAGACTGGCAAAAGCAACCTTGTCTGAGAAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997496
ATGGCTGGTAATTCGCAGGGCTCTCGACGCTTCACTCTGCAGGAAATTAATTCGATGCCTCTTCTGGGATTGAAACTCCAAAAATCGGAGTCGTTGTTTAGTTTGTTGGAATCAAGACTGGCAAAAGCAACCTTGTCTGAGAAGCTAAAGGCATCCAGTTTCCCACTCTCCGCTATTCGTGTAGGAAACTGGAAGAGGGTGTCTAAGCTCGAAGGCGAGTTGACTGGCAAAGTGTACTATGCAAAGAAAAGGCTTGTTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778806.1
MAGNSQGSRRFTLQEINSMPLLGLKLQKSESLFSLLESRLAKATLSEKLKASSFPLSAIRVGNWKRVSKLEGELTGKVYYAKKRLVWELLVGRLKIKMEISWSDITAIQAVLEPNQSGYLQIELANPPLFYRETTPQPRKHTNWQQTSDFTNGEAPICRRHIAMCPPGALDKHYEKLLRSDEHLFQLSQRPFPTHNSPYFNTVVLPSPSLITFHHPQQQQSLYPTMTAATSIHNGVAAVWENQINNEAKFVVNTSRPNFI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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