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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002901`

染色体: Chr08 坐标: 28979467-28985858 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002901`
名称	SmilChr08G002901
描述	3'-5' exonuclease-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28979467 - 28985858 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997506`
GeneID	`130997506`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997506`
原始查询	`SmilChr08G002901`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3'-5' exonuclease-like
产物	3'-5' exonuclease-like
Arabidopsis	`AT3G12410` (AT3G12410) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820420] identity=31.4; qcov=1.02; evalue=1.23e-25; confidence=low
Rice	`Os01g0300000` - identity=42.6; qcov=0.961; evalue=8.03e-52; confidence=medium
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0006139 (nucleobase-containing compound metabolic process); GO:0008408 (3'-5' exonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF01612 (DNA_pol_A_exo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997506

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778825.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778825.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778825.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778825.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778825.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28979503`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:28979607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A24,B42,C35
`Chr8:28979607`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B42,C35
`Chr8:28979613`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C22
`Chr8:28979613`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C22
`Chr8:28979654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,C46,C51,C63,C8
`Chr8:28979671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B13,C8,C87,D7
`Chr8:28979671`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,C8,C87,D7
`Chr8:28979674`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:28979689`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B4,B90,C28,C3,C36
`Chr8:28979717`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	34	A15,A18,A19,A8,B109,B110,B114,B12,B121,B134,B140,B27,B53,B55,B56,B69,B74,B77,B90,B92,B96,B97,C2,C21,C22,C24,C36,C42,C59,C78,C82,C9,D1,D5
`Chr8:28979748`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778825.1

203 aa

102

203

DNA_pol_A_exo1

PF01612 DNA_pol_A_exo1 45-202 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778825.1`	Pfam	`PF01612`	DNA_pol_A_exo1	Domain	45	202	2.3e-20	73.8	3'-5' exonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922842.1
TGCATGTACACCAACCAAGCAAAAATTAATTAAGATGTCTTCAATTTCCTTCAACCCTAGAACCTCCAAATACCATGTCACCTTCGCCGGAACAACCATCGAGACCACCGTCACCGACAAGGCCGCCACCGCCTCCGAATGGGTCCGCGGGATCACCGCCCTCTACGGCGTAAGCCCCGCCGTGGTCGGCCTCGATGTTGAGTGGCGGCCCCACCACATCCCCTACATGAGCAACAAGTCAGCCACCCTTCAACTTTGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997506
ATGTCTTCAATTTCCTTCAACCCTAGAACCTCCAAATACCATGTCACCTTCGCCGGAACAACCATCGAGACCACCGTCACCGACAAGGCCGCCACCGCCTCCGAATGGGTCCGCGGGATCACCGCCCTCTACGGCGTAAGCCCCGCCGTGGTCGGCCTCGATGTTGAGTGGCGGCCCCACCACATCCCCTACATGAGCAACAAGTCAGCCACCCTTCAACTTTGCATAAACAACAAGTGCTTAATCATGCAGCTCTTCTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778825.1
MSSISFNPRTSKYHVTFAGTTIETTVTDKAATASEWVRGITALYGVSPAVVGLDVEWRPHHIPYMSNKSATLQLCINNKCLIMQLFYMDQIPQSIKAFLLNPNFTFVGVEVEDDVSKLRNEYGLDCSRTMDVRAAAKARWPCRFSRPGLKDLAREVCNLYMAKPLHVCRSDWDARVLSEAQVEYACIDAFASYKIGHKLLYEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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