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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002916`

染色体: Chr08 坐标: 29132094-29134365 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002916`
名称	SmilChr08G002916
描述	polygalacturonase At1g48100-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29132094 - 29134365 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997517`
GeneID	`130997517`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997517`
原始查询	`SmilChr08G002916`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polygalacturonase At1g48100-like
产物	polygalacturonase At1g48100-like
Arabidopsis	`AT1G02460` (AT1G02460) Pectin lyase-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839443] identity=64; qcov=0.9; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0296200` (OsPGL13) - identity=58.1; qcov=0.857; evalue=9.33e-172; confidence=high
GO	GO:0004650 (polygalacturonase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00295 (Glyco_hydro_28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997517

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057778835.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057778835.1`
3	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057778835.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778835.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778835.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29132623`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:29132755`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:29132757`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr8:29132981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C9
`Chr8:29133566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:29133768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr8:29133844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:29133901`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B75
`Chr8:29133901`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778835.1

453 aa

226

453

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 81-404 aa

XP_057778836.1

451 aa

226

451

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 81-402 aa

XP_057778837.1

448 aa

224

448

Glyco_hydro_28

PF00295 Glyco_hydro_28 81-399 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778835.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	81	404	8.5e-92	308.4	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057778836.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	81	402	5.2e-94	315.7	Glycosyl hydrolases family 28
`XP_057778837.1`	Pfam	`PF00295`	Glyco_hydro_28	Repeat	81	399	2.2e-89	300.5	Glycosyl hydrolases family 28

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922854.1
GAATGGTGTAGTATAATACTACCGACCTGAATTTTAAAAAAAAAATAAATAAAAAATAAGCAGAGCTTCCACTTCGAGTTCCCAGTATATAAGCCAAGTATGAATTTGGTGTGCTCATCAACTTGGTGACATTCGTGCACCCATTTGTATTCTTGAGTGGTCACATGCTCTCAACTCTCAAACCCTAGGCTAAGATATATCCTTCTCTTCCCTTCCAATACCCATAGCTATTGCATGCGCCCCTCTGCACTTGCATACAT...

XM_057922852.1
GAATGGTGTAGTATAATACTACCGACCTGAATTTTAAAAAAAAAATAAATAAAAAATAAGCAGAGCTTCCACTTCGAGTTCCCAGTATATAAGCCAAGTATGAATTTGGTGTGCTCATCAACTTGGTGACATTCGTGCACCCATTTGTATTCTTGAGTGGTCACATGCTCTCAACTCTCAAACCCTAGGCTAAGATATATCCTTCTCTTCCCTTCCAATACCCATAGCTATTGCATGCGCCCCTCTGCACTTGCATACAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997517
ATGTTGCATTTTCCCCTGTTTTTGTTTTTGGCTATCACACTACACTCCTTCACTCTCTCAGCTCAGCACCGCATCCTAGTATCTCAAATCTCCGCATCACCTTCGCCCGCCCCTCAGCTTCCGCCTCCGCTCATCGGCGTCATGTCTCCTTCTCCGCTCTTCAGCGTGCTCTCGTATGGAGCCGTCGGCAACGGCGTCGCCGACGACACCCAGCCATTTAAAATGGCTTGGGACGCCGCTTGCCAAGCCAATGATCCCGC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778835.1
MLHFPLFLFLAITLHSFTLSAQHRILVSQISASPSPAPQLPPPLIGVMSPSPLFSVLSYGAVGNGVADDTQPFKMAWDAACQANDPAVIFVPMHYTFMIQSTIFSGPCKSELIFRIEGNIMAPDGPHSWPKNNSKRQWLVFYRIDGMSIQGGGTIDGRGQKWWELPCKPHRGPKGTTLPGPCDSPVAVRFFWSSNLVVKGMKMKNSPQFHFRFDSCHNVHIESLYIKSPALSPNTDGIHVENSNNVYIYNSVIASGDDCV...

XP_057778836.1
MLHFPLFLFLAITLHSFTLSAQHRILVSQISASPSPAPQLPPPLIGVMSPSPLFSVLSYGAVGNGVADDTQPFKMAWDAACQANDPAVIFVPMHYTFMIQSTIFSGPCKSELIFRIEGNIMAPDGPHSWPKNNSKRQWLVFYRIDGMSIQGGGTIDGRGQKWWELPCKPHRGPKGTTLPGPCDSPVAVRFFWSSNLVVKGMKMKNSPQFHFRFDSCHNVHIESLYIKSPALSPNTDGIHVENSNNVYIYNSVIASGDDCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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