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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002920`

染色体: Chr08 坐标: 29221274-29232428 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002920`
名称	SmilChr08G002920
描述	nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29221274 - 29232428 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997522`
GeneID	`130997522`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997522`
原始查询	`SmilChr08G002920`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase-like
产物	nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase-like
Arabidopsis	`AT5G50400` (PAP27) purple acid phosphatase 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835108] identity=72; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0531000` (NPP1) - identity=71; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003993 (acid phosphatase activity); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00149 (Metallophos); PF14008 (Metallophos_C); PF16656 (Pur_ac_phosph_N); PF17808 (fn3_PAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997522

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.60000	`XP_057778842.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057778842.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778842.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778842.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778842.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29221653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B16,B8
`Chr8:29222102`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B129,B18,B84,C1
`Chr8:29232243`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778842.1

627 aa

314

627

fn3_PAP

Pur_ac_phosph_N

Metallophos

Metallophos_C

PF17808 fn3_PAP 59-180 aa PF16656 Pur_ac_phosph_N 188-291 aa PF00149 Metallophos 303-518 aa PF14008 Metallophos_C 543-602 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778842.1`	Pfam	`PF17808`	fn3_PAP	Domain	59	180	1.1e-46	158.5	Fn3-like domain from Purple Acid Phosphatase
`XP_057778842.1`	Pfam	`PF16656`	Pur_ac_phosph_N	Domain	188	291	1e-11	46.0	Purple acid Phosphatase, N-terminal domain
`XP_057778842.1`	Pfam	`PF00149`	Metallophos	Domain	303	518	6.3e-17	63.4	Calcineurin-like phosphoesterase
`XP_057778842.1`	Pfam	`PF14008`	Metallophos_C	Domain	543	602	2.7e-15	57.5	Iron/zinc purple acid phosphatase-like protein C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922859.1
CACAGCCAAAACAAGCAAGGAAGATGAAGCTCTTAGCTATACTTTTTGTAGTCATTGTTACTTTAGTTTCATCATCTTCTTCTTCATCAGTGCTTCACAGTGATGGCAGAGAAAAGGGTAGGGTGGTGGCGGGAGAGCAGCCCTTGTCGAAGATAGCTATCCACAAAACTGTTGCTGCTCTCCGCCCTTCGGTCTCCGTTAAAGTCTCTCCGCGACTCCTCGGAATTCAAGGCGAGGACACTGAGTGGGTTGACGTCCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997522
ATGAAGCTCTTAGCTATACTTTTTGTAGTCATTGTTACTTTAGTTTCATCATCTTCTTCTTCATCAGTGCTTCACAGTGATGGCAGAGAAAAGGGTAGGGTGGTGGCGGGAGAGCAGCCCTTGTCGAAGATAGCTATCCACAAAACTGTTGCTGCTCTCCGCCCTTCGGTCTCCGTTAAAGTCTCTCCGCGACTCCTCGGAATTCAAGGCGAGGACACTGAGTGGGTTGACGTCCGTCTTCAGAATCCTCAACCTTCTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778842.1
MKLLAILFVVIVTLVSSSSSSSVLHSDGREKGRVVAGEQPLSKIAIHKTVAALRPSVSVKVSPRLLGIQGEDTEWVDVRLQNPQPSEDDWVGVFSPAKFNESICEPEADALDEGETPYLCTSPIKYKYANFSNLNYTKTGNTTLKFQLINQRADFSFALFTGGLSNPKLVAVSNHISFANPKAPLYPRLAQGKSWDIMTVTWTSGYNIDEAVPFVEWGWKGHTQVRSPAGTLTFSRGSMCGGPARTVGWRDPGFFHTSFL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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